历年来，医学院共获得国家级教学成果奖9项，国家级精品课程20门，国家级双语课程3门。《常见慢性病的健康管理》成为国内首门护理专业的大型开放式网络课程（MOOC）。

在全力投身实践国家教育教学改革中，医学院严格执行教育部对“985”“211”部属重点大学成人学历教育与网络教育相关要求，已逐步形成良好的办学氛围，并持续提升教学质量。在上海市教委校外学习中心办学评估检查中，我院网络教育学院13个学习中心整体评估排位全市第一。其中7所学习中心荣获“中国远程优秀校外学习中心称号”。

医学院紧紧围绕国家“双一流”的战略决策，以整体提高学科建设和人才培养质量内涵为出发点，以培养卓越医学创新人才为落着点，推动世界一流医学院和一流医学学科建设。整体布局、重点突出，稳步推动国家转化医学重大科技基础设施项目的建设。以高峰高原学科建设带动新一轮学科布局优化。现有国家教育部重点学科（三级学科）16个，上海市重点学科18个，上海高校一流学科9个。

在ESI全球医学学科排名中，医学院共有6个学科跻身全球研究机构前1%，其中临床医学学科跻身全球研究机构前1‰。根据教育部学位与研究生教育发展中心2013年公布的学科评估结果，我院临床医学全国排名第一、口腔医学排名第二、基础医学排名第三、护理学排名第五、公共卫生与预防医学排名第十，标志着我院学科综合实力稳居全国前列。

聚焦上海“四个中心”和建设具有全球影响力的科技创新中心总体要求，对接国家科技体制改革发展方向，不断增强科技创新能力和推动成果转化。医学院共获得国家级科技成果奖70项，其中国家最高科学技术奖1项，国家自然科学奖6项，国家技术发明奖10项，国家科技进步奖53项。近五年来，国家自然科学基金项目数累计达2387项，2015年获得537项，连续六年稳居全国第一。2010-发表SCIE论文9721篇，医学学科论文数第五次位列全国第一，其中表现不俗文章数2918篇，占同期论文数的近1/3。

科技工程及平台建设成绩显著。医学院顺利完成“985工程”三期创新能力建设任务，建设了4个转化医学研究基地及2个公共卫生平台，并依托医学院基础研究特色和临床优势，在附属医院建设了覆盖十大病种的生物样本库。上海高校知识服务平台——转化医学协同创新中心初步实现了产学研良性互动及转化平台的建设目标，挂牌为上海市协同创新中心进行建设。2015年与中国科学院神经科学研究所共同建设“脑疾病临床研究中心”，探索性实践院所同城协同、联合攻关的科研组织新模式。近五年来，医学院共获授权专利数571项。