品格与社会、体育与健康、语言与人文、数学与科技、艺术与审美。从学校课表可以看出其中的特色，比如，体育健康、经典阅读、创新实践尤为突出。课时也从原来40分钟一节课，调整为90、60、35、10分钟不等的长、短、微课时。每周五下午设“创新与实践”课，开展跨学科主题实践，如戏剧表演等。一年级（5）班张馨然说：“我特别期待周五，一下午的创新实践课，就像爱丽丝梦游仙境一样，总是有那么多的惊喜。”

体育是附小的核心课程。在附小，体育课程被分解为十余种项目，供孩子选择。轮滑、板球、棒球、足球等，在同一时间，学生打破班级限制，根据爱好组成新的班级。每个清华附小学生，至少熟练掌握两个运动项目。学校特意拿出1节课开展足球专项训练。2016年附小举办了自己的“世界杯”，每个班都有自己的足球队，代表一个“国家”参赛。

清华大学副校长谢维和这样评价，“1+X课程”真正适应和符合了教育的规律，抓住了小学作为基础的特定含义。这就是清华附小人的“主题”和自我教育，也是学校老师们共同的信念。