学校目前有各类在校生12000多名，其中硕士研究生302名，本科生4977名，高职生645名。已形成集全日制研究生教育、本科教育、高等职业技术教育、继续教育、职业教育为一体的多层次、多形式的办学格局和教育体系。

学校不断改善办学条件。经过两年多建设，环境优美、宽阔舒适的新校区已落成，2008年已实现整体搬迁。学校现占地面积1000多亩，建筑面积18万平方米。其中教学楼面积25100平方米，有83个教室，可容纳9000余名学生同时上课；图书馆面积21400平方米，有18个阅览室、自习室，同时可供2000人阅览学习，馆藏图书64万余册(种)，电子图书29万余种(册)；实验室面积33660平方米，一次性可供4000名学生做实验。公共服务体系日臻完善，建成了现代化的校园计算机网络。现有教职工(含附院、职院)2335名，其中正高职称191名，副高职称467名。有硕士研究生导师191人，6人获自治区有突出贡献专家称号，17人享受政府特殊津贴。主办的《包头医学院学报》为省级公开发行刊物，2007年获第二届北方优秀期刊奖。

学校注重发挥学科综合优势，大力开展科学研究。近3年来，先后承担各级各类科研项目184项，其中国家自然科学基金项目3项，省部级和包头市科研成果奖励29项，科技成果推广项目16项。承担省部级以上教学研究项目14项，获各类教学成果奖励7项。在国内外学术期刊发表论文1033篇，主编或参编出版教材54部，其中国家级规划教材20部。

学校坚持开放办学，先后与北京大学医学部、首都医科大学、天津医科大学、山东大学医学院、西安交通大学医学院等国内多所知名院校建立密切合作关系，与英国设菲尔德大学、韩国极东大学建立友好关系，与英国北方总院、巴恩思利医院、设菲尔德大学儿童医院建立友好协作医院，并聘请部分国内外知名人士为名誉教授。