学校现设有临床医学、预防医学、卫生检验、医学检验、医学影像学、护理学、麻醉学、口腔医学、法医学、药学、运动康复与健康、放射医学等12个本科专业和临床医学(骨科方向)、临床医学(肿瘤学方向)、临床医学(急救医学方向)、临床医学(康复治疗方向)、护理学(麻醉护理方向)、护理学(助产方向)、生物技术(医学生物技术方向)、生物技术(医学实验技术方向)、法学(医事法律方向)、应用心理学(医学心理方向)、英语(医学英语方向)、公共事业管理(卫生事业管理方向)、信息管理与信息系统(医学信息方向)、药学(临床药学方向)、市场营销(医药营销方向)等15个专业方向；有护理、护理(助产方向)、医学检验技术、医学影像技术、眼视光技术、医学美容技术、康复治疗技术、医药营销等8个专科专业及方向。13个硕士学位授予学科，涵盖了医、理、管、法、文等学科门类。临床医学、预防医学、麻醉学、医学检验等4个专业为自治区品牌专业，其中预防医学专业为教育部特色专业建设点；生物化学、人体解剖学为自治区教育系统重点学科，药理学和生理学为自治区教育系统重点培育学科，附属医院的肾脏内科学、消化内科学等2门学科为自治区临床医学领先学科，神经外科学、风湿病与自体免疫病学、急诊急救医学等3门为自治区临床医学重点学科；营养学实验室、人体解剖学实验室和医学生物化学实验室等3个实验室为自治区重点实验室；基础医学实验教学中心、预防医学实验教学中心、临床基本技能实验教学中心和医学技术实验教学中心等4个教学中心为自治区级示范中心；生理学、环境卫生学、人体解剖学、病理学、生物化学与分子生物学、药理学、卫生统计学、流行病学、内科学、食品卫生学、病理生理学、职业卫生与职业医学等12门课程为自治区精品课程。内蒙古基因诊断研究所、内蒙古应用解剖研究所、内蒙古消化病研究所、内蒙古高血压病研究所等设在我校。