科研竞争力提升迅速。2015年度国家社科基金重大项目、国家社科基金、国家自然科学基金等项目数和经费均名列全国高校前列。学校还取得了一批重要的科研成果,2011年至2014年共获得7项国家自然科学二等奖,居同期国内高校第三,获3项国家科技进步二等奖。发表高水平论文显著增加,高被引论文篇数增长明显。学校进入ESI前1%的学科领域数已达17个,列国内高校第三。

此外,2012年教育部学科水平评估中,中山大学33个参评学科中,有16个学科进入前5(按学科水平排名),32个学科进入前10。一批学科领域进入QS、ARWU、USN等大学排行榜的世界学科排名,如2016年的QS学科排名中,地理进入前101-150名,哲学进入前151-200名;2015年的ARWU学科排名中,数学、化学进入前51-75位,计算机进入前101-150;在2016年USN学科排名中,材料科学、药理学与毒理学、化学、数学、计算机科学等均进入前100。