商业类国企改革面临的另外两个问题是，重要领域控股国企如何实行混合所有制，以及自然垄断国企能否实现有效股权多元化。前者可能问题是，民间资本不敢进入国企，担心自己成为唐僧肉。后者可能问题是，虽然股权结构多元，但由于都是国有资本，如何体现出资人权益，不让股权结构流于形式，仍需要在操作层面加以细化。

对于公益类企业的考核是个创新，即不考核利润，而是考核成本、质量、效率和能力，并且引入社会评价。这种考虑有利于国有企业提供高质量公共产品，不过如果考核不是由第三方机构提供，而是仍由国资委进行的话，考核标准可能要打折扣。因此，公益类国企的考核改革应进一步完善。

二、整体上市，股权灵活

方案强调完善现代企业制度，大力推动国有企业整体上市，特别是集团资产上市。这预示国家将大力依靠资本市场，对国有资产进行重组。

改革提出优先股和特殊股概念，这两种方式增加了国有资本的灵活性。前者可以在充分竞争的商业类国企中增加民间资本数量，以国企经营权换民间资本，从而扩大国企竞争力。后者则可以通过特殊股形式，在不绝对控股条件下，实现对企业的政策引导，这对于传媒类等既有政治要求，又需要灵活经营的企业而言，具有实际操作意义。

改革强调公司经营独立性，法无授权，政府不得干涉企业经营，这有利于提高国有企业经营效率。要求外部董事占多数的公司治理结构设计，也有利于克服内部人控制的弊病。不过中国上市公司长期实行的独立董事作用被人诟病，外部董事的遴选能否体现公众利益，而不是国资委对外部董事的利益输送，实际成为国资委代言人，仍需要有效制度安排。董事会避免一把手说了算，一人一票的制度设计值得肯定，关键问题还是董事会人员构成，是否合理有效，而不是仅仅体现国资委意志。

另外两个值得肯定的改革措施是，一个是国有企业领导人员分层分类管理，一个是建立市场薪酬分配制度。党管干部是国企原则，但分层分级管理使得领导人员使用增加了灵活性，选任制、委任制和聘任制同时使用，在确保党领导基础上，实现了人员选用市场化。而在经理层，若能实现董事会选聘和管理经理人，则能够有效保障公司治理有效实行。