学校学科特色明显，基础扎实，科技创新能力不断提升。中医临床基础为国家重点学科；拥有省部级重点学科54个，其中浙江省“十二五”重中之重一级学科2个、重中之重学科1个，国家中医药管理局重点学科25个；入选浙江省“十三五”“一流学科建设工程”项目A类3个、B类6个。建有以血液病为重点研究病种的国家中医临床研究基地。拥有国家中医药管理局协同创新中心1个、国家中医药管理局重点研究室3个、国家中医药科研重点实验室10个、浙江省重点实验室4个、浙江省“2011协同创新中心”1个，浙江省公共科技条件平台2个、浙江省重点科技创新团队4支。获国家科技进步奖、国家技术发明奖5项，浙江省科学技术一等奖8项。办有《浙江中医药大学学报》、《浙江临床医学》2种学术期刊，其中《学报》是全国对外发行最早的中医学术刊物之一，在20多个国家和地区发行，被美国《化学文摘》、波兰《哥白尼索引》等国际著名检索系统收录。先后与丽水市、磐安县、甘肃省渭源县、江西省樟树市等地开展产学研战略合作，积极服务地方经济社会和中医药事业发展。

学校积极发挥中医中药特色优势，不断推进国际交流与合作。已与美国、德国、英国、巴西、日本、韩国、香港、台湾等31个国家与地区的87个教育、科研、医疗单位建立了合作关系，招收了56个国家与地区的国（境）外学生，先后聘请了40余位外国专家学者为客座教授。学校是世界中医药学会联合会风湿病等3个专业委员会的副会长单位，也是世界针灸学会联合会教育及其国际针灸水平考试基地，建有浙江省来华留学生中医文化教育基地。

当前，全校师生正秉承“求本远志”校训，坚持“学生为本、学术至上”理念，弘扬“大医精诚、锐意创新”精神，致力于建设以中医中药为特色，多学科协同发展，优势突出，具有国际影响的教学研究型大学。