建有1个国家级实验教学示范中心（船海与港航工程实验教学中心）、1个国家级大学生校外实践教育基地（浙江海洋学院—扬帆集团股份有限公司工程教育实践中心）、1个国家自然科学基金委野外实习基地（长江口及邻近海域海洋生物与生态野外实习基地）以及国内首个海岛野外生存实验基地和全国海洋意识教育基地。教学成果获国家二等奖1项（第三完成单位），浙江省一等奖3项（其中第三完成单位1项）、二等奖9项。学生课外科技和文体竞赛多次获得一等奖殊荣，社会实践系列调查报告集《蓝色报告》得到现任国家主席、时任浙江省委书记习近平的来信肯定，涌现出“浙江骄傲人物”刘凌云、“中国大学生自强之星”段自豪等一批优秀学生代表，“海洋文化”被评为浙江省高校首批校园文化品牌，学校列为国家级大学生创新创业训练计划项目实施高校。毕业生深受用人单位欢迎，当年就业率保持在95%以上。
学校以学科建设为龙头、科学研究为支撑，积极推进协同创新，全面提升科研水平与社会服务能力。现有1个省重中之重学科（海洋科学）、6个省重点学科（水产、船舶与海洋工程、生物化学与分子生物学、水产品加工及贮藏工程、海洋生物医药、油气储运工程），设有海洋科学、水产、船舶与海洋工程3个一级学科、11个二级学科硕士学位授权点，具有8个农业推广硕士专业学位授权领域（渔业、养殖、食品加工与安全、农业机械化、农业信息化、农村与区域发展、设施农业、农业科技组织与服务）和同等学力硕士学位授予权。在教育部最近一轮学科评估中，学校海洋科学、水产、船舶与海洋工程三大主干学科均取得较好名次，其中海洋科学进入全国同类学科前5名。建有1个国家级工程技术研究中心（国家海洋设施养殖工程技术研究中心）和1个国家地方联合工程实验室（海洋生物种质资源发掘利用国家地方联合工程实验室），7个省部级实验室（浙江省海水增养殖重点实验室、浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室、浙江省船舶工程重点实验室、浙江省水产品加工技术研究重点实验室、浙江省海洋渔业资源可持续利用技术研究重点实验室、东海海洋生物种质资源发掘浙江省工程实验室、浙江省海洋渔业装备技术重点实验室），1个省部级服务平台（浙江省海洋科技创新服务平台），9个省部级研究中心（中国海洋文化研究中心、国家头足类水产品加工技术研发分中心、农业部渔业环境及水产品质量检验测试中心、江海通达新船型研发中心、浙江省海洋生物医用制品重点工程技术研究中心、浙江省海洋药物研究中心、浙江省海洋增养殖工程技术研究中心、浙江省船舶先进制造技术研发中心、浙江省海洋功能保健产品研发中心），2个省部级监测站（农业部重点渔场渔业资源科学观测实验站、东海区渔业资源动态监测网浙江省监测站）和1个省部级研究基地（浙江省非物质文化遗产研究基地）。开设浙江省远洋渔业培训中心、中国石化销售公司舟山培训中心等培训组织，学校入选国家渔政局首批海洋渔业船员一级培训机构。历史上曾获国家科技进步一等奖和三等奖各1项、二等奖2项，全国科学大会奖6项；提出了东海伏季休渔的建议案并被国家采用。近年来主持了一批国家863计划、国家科技支撑计划、国家现代农业专项、国家重大国际科技合作计划和国家自然科学、社会科学基金项目，年度科研经费达到8000万元；主持完成了我国唯一的海域基准价核定标准《浙江省海域基准价核定规程》、我国首部海域使用权价值评估地方标准《浙江省海域评估规范》和世界首个石首鱼科鱼类--大黄鱼全基因组序列图谱；授权专利1200余项，其中发明专利200余项；获国家科技进步二等奖（排名3）、中国商业联合会科学技术奖特等奖、教育部科学研究优秀成果奖一等奖、省科技进步一等奖、国家海洋创新成果奖一等奖和中国专利优秀奖等省部级及以上奖励40余项。与浙江沿海企业单位、政府部门以及国内外大院名校组建了40余个科技创新服务载体，连续参与中国海洋文化节相关活动，主办中国海洋文化论坛、国际海洋科技论坛等各种学术会议，为区域海洋经济社会发展做出了重要贡献。
学校坚持实施“人才强校”战略，大力加强师资队伍建设。现有教职工1300余人，其中专任教师850余人，博士150余人，教授110余人。近百名教师入选省新世纪151人才、高校中青年学科带头人、钱江人才等培养资助计划，拥有国家“千人计划”获得者、国家“杰出青年基金”获得者、省“千人计划”获得者、钱江学者等一批高层次人才，设有一批省级科技创新团队、教学团队和教学名师。物理海洋和环境海洋学家、中国科学院院士冯士筰为学校名誉院长；聘请地质学家、中国科学院院士殷鸿福等专家在校设立“院士专家工作站”；海洋腐蚀与防护学家、中国工程院院士侯保荣，海洋遥感专家、中国工程院院士潘德炉，生物海洋学家、中国科学院院士焦念志，军事医学与药物化学专家、中国工程院院士陈冀胜，香料和食品添加剂专家、中国工程院院士孙宝国等受聘为学校客座教授。
学校坚持走国际化、开放式的办学道路，积极开展对外交流与合作。建有国家科技部海洋领域国际科技合作基地和国家外国专家局中国海洋科技创新引智园区（共建），具有外国留学生、港澳台学生招生权。与美国、加拿大、日本、俄罗斯、白俄罗斯、挪威等国（境）外40多所高校和科研机构建立了紧密的合作关系，与俄罗斯圣彼得堡海洋技术大学联合举办了船舶与海洋工程专业，与日本东京海洋大学等一批高校开展了学生互换交流，与挪威生命科学大学等若干高校开展了联合培养博士研究生项目，每年均选派一定数量的优秀学生赴国（境）外相关高校攻读硕士、博士学位。
21世纪是海洋世纪，开发海洋，科教先行。国务院批复的《浙江海洋经济发展示范区规划》和《浙江舟山群岛新区发展规划》等明确提出，要在舟山“建设国家级海洋科教基地”，“努力把浙江海洋学院发展为海洋类大学”。当前，学校正借势“海洋强国”战略实施和浙江海洋经济发展示范区、浙江舟山群岛新区建设机遇，坚持立足新区、面向海洋、走向世界，坚持内涵发展、协同创新和国际化办学，进一步优化结构、凝炼特色、强化优势、提高质量。争取到2020年，建成特色鲜明并在国内外具有影响的高水平综合性海洋大学，成为我国重要的海洋人才培养基地，海洋科技研发平台，海洋高新技术孵化园区，海洋科技引智载体和海洋人文社科研究中心。