学院具有较强的基础理论和临床医学科研力量。“九五”以来，共发表省级以上科研论文600余篇，出版论著近200部，编写成人高等教育教材31部，参编或主编国家统编本科教材18部。有82项课题中标，被列入省部级科技项目计划。2001年我院“中药保鲜饮片”课题得到国家计委中药现代化示范工程专项立项，获调产扶持资金1050万元；2002年有四项课题获国家中医药管理局立项；2003年又有两项课题获国家自然科学基金立项，标志着我院的科研工作取得了突破性进展。

为了进一步扩大对外交流，学院受国家经贸委委托，已连续五年成功举办了“国际针灸培训班”，得到了来自30多个国家的数百余名外国学者以及国家经贸委的高度评价。为了促进中医药走向世界，学院每年选送学生赴日本进修，并开办了对外留学生教育。

祖国医学是一座伟大的宝库，在社会发展日新月异的今天，人类更加渴望与大自然和谐的相处，从而在世界范围内广泛地兴起了“中医热”、“中药热”和“针灸热”。培养大批德才兼备的具有较强动手能力和创新精神的高级中医药专门人才既是人类健康和社会发展的需求，也是中医药事业向前发展的必然选择。山西中医学院将在继承和发扬祖国医学，攀登医学科学高峰的道路上不断发展壮大，谱写新的篇章。