2012年12月，国务院学位委员会批准我校成为“服务国家特殊需求人才培养项目”--学士学位授予单位培养临床医学硕士专业学位研究生试点工作单位，并于2013年开始首批招录和培养临床医学硕士专业学位研究生，办学层次取得了历史性突破。，我校顺利通过了国务院学位委员会组织的培养硕士专业学位研究生试点工作的中期考核。目前已招收临床医学硕士专业学位研究生三届，专业领域涵盖临床医学中内科学、外科学、麻醉学等10个二级学科。2015级研究生与住院医师规范化培训实行并轨，临床实践能力培训在国家住院医师规培基地接受住院医师规范化培训。

近五年来，学校共承担各类科研项目168项，其中承担国家自然科学基金项目6项，省部级科研项目82项；获科研奖励19项，其中省部级奖励4项；发表论文1975篇，被SCI收录102篇；出版学术专著、主编参编教材366部。主办的《长治医学院学报》与全国100余所院校进行了科技期刊交流。

学校坚持开放办学，加大对外交流力度，先后选派教师赴美国、英国、加拿大、法国、南非、瑞典、澳大利亚、日本、台湾、香港等国家和地区进行访问研修、学术交流。邀请美国圣·路易斯大学医学院、加州大学、伊萨卡大学等著名专家学者来院讲学。与美国罗克福德学院、英国阿伯丁大学、韩国大田保健大学校等知名院校签订了合作协议，建立了友好合作关系。先后6次成功举办中美大学生文化交流活动，4次举办中美心血管疾病国际研讨会。此外，还举办了全国血液病新进展研讨会、全国生物医学工程教育研讨会、全国省（市、区）属医学院校合作年会等一系列有重要影响的学术会议。

长治医学院是莘莘学子成长成才的摇篮，是培养新世纪高素质应用型医学人才的沃土。面向未来，全面贯彻《国家中长期教育改革和发展规划纲要（2010-2020年）》，以人才培养为中心，以立德树人为根本，确立以本科教育为主、适度发展研究生教育，培养实践能力强、具有岗位胜任力的应用型医学人才的办学定位，按照学校提出的“全面加强党的建设，全面深化各项改革，全面推进依法治校，全面推进内涵发展，全面融入区域社会”五个全面总框架，求真务实、乘势而上，朝着建设高水平教学应用型医学院校的发展目标而努力奋斗