学校现有国家重点学科5个：中西医结合临床、肿瘤学、外科学（泌尿外科学）、外科学（神经外科学）、内科学（内分泌与代谢病）。“211工程”重点建设学科10个：中西医结合临床、肿瘤学、外科学（泌尿外科学）、神经外科学与神经病学、内科学（内分泌与代谢病）、影像医学与核医学、病原生物学与免疫学、病理学与病理生理学、公共卫生与预防医学、药学。天津市重点学科17个：中西医结合临床、肿瘤学、外科学（泌尿外科学）、外科学（神经外科学）、内科学（内分泌与代谢病）、影像医学与核医学、病原生物学与免疫学、病理学与病理生理学、药学、营养与食品卫生学、外科学（胸心外科）、流行病与卫生统计学、生物化学与分子生物学、细胞生物学、生物治疗学、口腔医学、护理学。现有省部级重点实验室14个：乳腺癌防治教育部重点实验室、卫生部激素与发育重点实验室、免疫微环境与疾病省部共建教育部重点实验室、中枢神经创伤修复与再生省部共建教育部重点实验室、天津市肿瘤防治重点实验室、天津市泌尿外科基础医学重点实验室、天津市神经损伤变异与再生重点实验室、天津市细胞与分子免疫学重点实验室、天津市肺癌转移与肿瘤微环境重点实验室、天津市医学表观遗传学重点实验室、天津市临床药物关键技术重点实验室、天津市肿瘤免疫与生物治疗重点实验室、天津市功能影像重点实验室、天津市心血管病离子与分子机能重点实验室。建有天津医学表观遗传学协同创新中心。研究所15个：天津市内分泌研究所、天津市泌尿外科研究所、天津市神经病学研究所、天津影像医学研究所、天津心脏病学研究所、天津市医学检测技术研究所、天津市老年病学研究所、天津市肿瘤研究所、天津普通外科研究所、天津性传播疾病研究所、天津市眼眶病研究所、天津市感染性疾病研究所、天津市肺癌研究所、天津市麻醉学研究所、天津市消化疾病研究所。“十五”以来，学校共承担省部级以上科研项目2668项，获省部级及其以上科技奖励267项，其中国家级科技奖励5项，获省部级一等奖17项、二等奖86项。

学校有6所大学医院：总医院、第二医院、肿瘤医院、口腔医院、代谢病医院、眼科医院；肿瘤医院是全国首批国家肿瘤临床医学研究中心。大学医院13个专科入选国家临床重点专科建设项目：总医院的消化内科、神经外科、普通外科、呼吸内科、神经内科、急诊医学科、老年病科、医学影像科，肿瘤医院的胸外科、临床护理、肿瘤科、病理科，第二医院的泌尿外科。大学医院在维护人民群众身体健康以及应对突发公共卫生事件、抗震救灾、医疗援助等重大任务中做出了突出贡献。学校还有15所非直属临床学院：一中心临床学院、三中心临床学院、南开临床学院、眼科临床学院、心血管病临床学院、人民医院临床学院、第四中心临床学院、骨科临床学院、胸科临床学院、儿童临床学院、中心妇产科临床学院、宝坻临床学院、静海临床学院、泰达临床学院、海河医院临床学院，1所教学医院：北辰医院，共计19216张教学床位。