复旦大学现任校长为王生洪教授，党委书记为秦绍德教授。
复旦大学校训：“博学而笃志，切问而近思”；校风：“文明、健康、团结、奋发”，学风：“刻苦、严谨、求实、创新”。
学校现有人文学院、外文学院、新闻学院、法学院、经济学院、管理学院、技术科学与工程学院、生命科学学院、上海医学院、公共卫生学院、药学院、护理学院、信息科学与工程学院、国际关系与公共事务学院、社会发展与公共政策学院、数学科学学院和软件学院等17个学院(含66个系)和物理学系、化学系、高分子科学系、环境科学与工程系等4个系，68个学士学位专业，一级学科博士学位授权点22个，二级学科博士学位授权点135个(其中自设24个)，硕士学位授权点209个(其中自设38个)，并设有25个博士后科研流动站。
学校学科门类齐全，现有马克思主义哲学、外国哲学、政治经济学、世界经济、金融学、产业经济学、政治学理论、国际关系、中国古代文学、汉语言文字学、传播学、历史地理学、基础数学、应用数学、运筹学与控制论、理论物理、凝聚态物理、光学、物理化学、高分子化学与物理、生态学、神经生物学、遗传学、生理学、电路与系统、微电子学与固体电子学、人体解剖与组织胚胎学、病原生物学、病理学与病理生理学、内科学（心血管病、肾病、传染病）、儿科学、神经病学、影像医学与核医学、外科学（普外科、骨外科、泌尿外科、神经外科）、眼科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、中西医结合基础、中西医结合临床、社会医学与卫生事业管理等40个国家重点学科，居全国第三位。
学校现有中国语言文学研究所、中国社会主义市场经济研究中心、美国问题研究中心、历史地理研究所、人口研究所、世界经济研究所、金融研究院、数学研究所、现代物理研究所、遗传学研究所、上海市心血管病研究所、上海市放射医学研究所、肝癌研究所等81个研究机构，145个跨学科研究中心，有先进光子学材料与器件、专用集成电路与系统、应用表面物理、遗传工程、医学神经生物学等5个国家重点实验室。还有10个教育部重点实验室和7个卫生部重点实验室，8个教育部人文社会科学重点研究基地。
学校现有各类学生近44,300余人，其中博士生3,500人，硕士生7500余人，普通本专科生15700余人，外国留学生2,200余人，成人教育本专科生8400人，网络教育本专科生近7000人。
学校拥有一支高水平的师资队伍，现有专任教师与科研人员2,300余人，其中教授、副教授1,350余人，中国科学院、中国工程院院士29人，博士生导师746人，教育部“长江学者奖励计划”特聘教授40人、讲座教授14人，“973”首席科学家6人，“国家级有突出贡献中青年专家”31人。近几年来，学校积极引进人才，实施教育部“长江学者奖励计划”，涌现出一批优秀的中青年教师，优化了师资队伍结构。学校还拥有中山、华山等9个附属医院，集医疗服务、临床教学与科研工作于一体。医院医疗设备先进、技术力量雄厚，有900多人具有正、副高级职称，为临床教学创造了良好的教学条件。
复旦大学把培养具有全面素质的高质量人才作为教学的根本目标。学校注意从自己的实际出发，大胆吸收国内外高校的成功经验，注重加强学科间的渗透、交叉、组合，发挥综合性大学多学科的特色和优势。经过长期的实践和探索，已经建立起一套比较完整的、有自身特点的教学计划和管理体系。学科建设全面启动，发展势头良好。
学校按照“厚基础、宽口径、重能力、求创新”的教学理念，将综合教育和文理基础教育为特色的通识教育和宽口径专业教育有机地结合起来。学校从1994年实施学分制教学管理，2001年全面推进学分制建设，通过调整课程设置、开放选择专业、推行学期开课制、设立自由选修学分等多种途径，从各个教学环节上落实学生个性发展，给学生以更多的自主选择权。学校大力提倡“名教授上基础课、带基础实验”，建有严格的教学质量保障体系，在历年的全国优秀教学成果奖评选中获奖数始终名列全国前茅。学校建立了一套有实效、有特色的教学管理制度，研制和开发了具有国内先进水平的《高校网上教务管理系统》，实行导师制等一系列措施，全面实现了科学化、专业化管理，并坚持不懈地整治教风和考风，形成了良好的学风和校风。
学校把加强和发展研究生教育视为建设世界一流大学的关键，始终以“提高研究生培养质量”为核心，激励研究生的创新能力，营造完善的成才机制和浓重的学术氛围。积极推进招生制度改革，扩大博士生导师的招生自主权，通过提前攻博、硕博连读和招收直博生制度来吸引优秀生源。通过加强课程建设和教材建设来完善研究生学位课程体系，以严格的科研训练和能力培养来激发研究生的自主创新潜力，实施学位论文开题报告、中期考核和博士资格考试等措施，提高研究生的培养质量。近年来，研究生发表的论文在质量和数量上都有较大的提高，在连续六届的全国百篇优秀博士学位论文评选中，我校有33篇入选，在全国名列第三。为适应国家现代化建设的要求，近年来着力于研究生教育专业结构的调整，大力发展专业学位研究生的培养，取得了很好的成效，得到社会的广泛认同。在2001年亚洲13所著名商学院参加的“亚洲创业计划大赛”上，我校MBA代表队囊括全部单项与总分冠军，在全国“华为杯”研究生电子设计大赛中，我校多次获团体和个人冠军。在第一届100名国家教学名师奖评审中，复旦2位教授获得殊荣；上海市首届52名教学名师奖评选中，有8名教授入选，居上海市各高校之首。
学校注重课堂内外教育的结合，鼓励学生开展学术研究和社会实践。设立了“学生科技创新基金”，“大学生暑期社会实践基金”，开办百台精品讲座，倡导读百本书，参加百项社会实践和实验课题，使以德育为核心，培养创新能力和实践能力，德、智、体、美相互渗透的素质教育，成为校园生活的主旋律。在反映学生科技创新能力的全国大学生“挑战杯”比赛中，复旦大学在1995年、2000年、2001年和2005年四次获得第一名，是获得第一名最多的学校。学生话剧团经常在校园上演世界名剧和自编自导自演的新戏。校男女排球队都是全国甲级队。艺术体操、射击是复旦大学的传统体育项目，在全国大学生比赛中屡次夺冠。
复旦努力以一流的师资，一流的管理，培养出一流的复旦人才。复旦培养的人才，在各自岗位上大显身手，赢得了社会的肯定和用人单位的普遍欢迎。本科毕业生绝大多数在4月底前能落实单位，五、六家单位争夺一名毕业生的现象也不乏其例。在全国高校毕业生就业市场竞争日益激烈的情况下，复旦本科生当年就业率近年来始终在95%以上。从毕业生流向，也可看出复旦人在社会发展中所担当的角色。进入国家机关的人数占毕业总人数的6%～7%，直升或考取研究生，以及留在高校及科研单位的约占40%。金融单位、各类公司企业、律师、会计师事务所等比例均较高。用人单位普遍反映，复旦的学生大多数具备自信心强、有协作精神、适应能力强等诸多优点，在工作中往往能脱颖而出。
复旦大学科技工作以面向国际科学前沿、面向国家战略需求、面向国民经济主战场为指针，以开展原始性科学创新研究、出一流科技人才与科技成果、服务于国家安全与区域发展为目标，以承担国家与地方重大科技项目、建设重大科学平台、培育优秀创新团队为抓手。作为首席科学家单位，目前承担国家重点基础研究发展规划项目（973项目）6项，国家自然科学基金重大项目1项。2004年获批准国家自然科学基金重点项目11项，上海市重大项目6项，获国家自然科学基金委优秀创新研究群体1个，获得国家级科技成果奖励4项，获得授权专利105项，发表SCI论文944篇。近几年，学校面向国民经济主战场，在专用集成电路、计算机网络工程、生物技术、有机纳米材料和催化剂研究等方面开发了一系列科技成果，产生了显著的社会与经济效益。在非线性数学、先进材料、人类基因组学、基础医学与临床医学等领域取得了重要的科技进展。
人文科学和社会科学研究方面，在历届上海市哲学社会科学优秀成果评选中，复旦的获奖等级和总数都以绝对优势领先，其中《中国历史地图集》、《英汉大词典》、《中国文学批评通史》获特等奖；有5项成果获2000年首届全国哲学社会科学基金规划项目优秀成果奖，其中由陆谷孙教授主编的《英汉大词典》获一等奖，是上海地区唯一的一等奖获得者。在2003年教育部中国高校第三届人文社会科学优秀研究成果奖的评比中，我校有5部著作荣获一等奖，获一等奖著作数排名全国第一。2004年我校获上海市哲学社会科学优秀成果奖82项，邓小平理论研究与宣传优秀成果奖12项，蒋学模、刘放桐获得首次设立的学术贡献奖；在2004年上海市的社科评奖中，我校获奖总数占全市的32%。2004年我校又获上海市决策咨询研究成果奖8项，获奖总数大幅度提高并首次位列上海高校第一。在2003年、2004年、2005年国家社科基金项目评审中，我校分别有20、28、23个项目立项，立项数连续数年位列上海高校第一。复旦还多次获得中国图书一等奖、“五个一工程”优秀图书奖、上海市优秀图书特等奖等奖项。
复旦大学积极兴办科技产业，推动产、学、研联合，促进科技成果转化。通过探索和实践，吸取了国内外有益的经验，实施多种模式发展科技产业，使学校科技成果转化及产业化工作得到了很大的发展，并且打造出了生机勃勃的“复旦”校办产业群，开辟出一条具有“复旦特色”的产业化之路。2004年，复旦大学国家大学科技园在英国威尔士南部设立办事机构，成功打开通往欧洲市场的大门。现有上市公司3家，其中香港创业板上市公司2家，如上海复旦微电子股份有限公司，是国内首家专门从事超大规模集成电路设计、开发、生产、销售的发起式股份有限公司，它是在香港上市的第一个复旦大学品牌的高科技企业，在“亚洲金融”杂志评出的2001年度中国大陆地区最佳企业排行榜上，该公司列为第10位，它的“神威1号”嵌入式32位微处理器的项目获得国家国防科技一等奖。
学校目前占地面积252万平方米，校舍建筑面积111万平方米，全校固定资产22亿元。学校现有各类实验室134个，其中有5个国家重点实验室，20个省部级重点实验室；拥有文理医3个图书馆，全校现有藏书445万册，居全国高校前列。
复旦大学已成为国际上有影响的学术中心之一，具有广泛紧密的国际联系，学术交流活动非常活跃，已与近30个国家和地区的150多所高校和研究机构建立了合作交流关系，并向300多位国际知名学者和人士授予了名誉博士、名誉教授、顾问教授等称号。美国前总统里根、法国前总统德斯坦、荷兰前首相吕贝尔斯、以色列前总理拉宾、德国总统约翰内斯?劳、德国前总理科尔、美国副总统切尼等外国元首或政府首脑，曾到复旦访问并发表演讲。复旦大学是全国四个对外汉语教学基地之一，留学生数名列全国第二。在校学生国际校际交流数不断增加，2004年出国出境学习学生达到637名，开拓了学生的眼界。复旦大学积极参与各类重要国际大学组织，继1998年成功举办东亚研究型大学年会之后，2000年成功举办21世纪大学校长协会第4次年会，2001年又成功举办了“环太平洋大学协会”第5次年会。随着国际地位的提升，复旦主办了相当多的学术会议，2002年学校主办了国际数学联盟执委会会议、国际合成金属会议和第七届世界对外汉语教学会议等高规格、大规模的国际学术会议，2004年举办国际学术会议60场次。复旦大学积极推进国际化进程，与美国耶鲁大学、日本早稻田大学、新加坡国立大学等世界著名大学建立了战略合作伙伴关系，2004年与27个国外大学及学术机构签订了交流协议。复旦校董会热心学校工作，学校每年都得到国内外校董及社会各界的大力资助。
日月光华，旦复旦兮。在国家教育部和上海市政府的重点投资下，复旦这所百年名校正力争建设成为一所立足上海、服务全国、国际一流的高水平、研究型的世界一流综合性大学，为人类文明进步，不断探索教育、科技创新和制度创新成果。