学校现有本科专业62个，涵盖经济学、法学、文学、理学、工学、农学、医学、管理学和艺术等九个学科门类；拥有国家级教学及人才培养基地12个，国家级校外实践教育基地9个，国家级实验教学示范中心7个，国家级虚拟仿真实验教学示范中心2个，国家工程实践教育中心5个，上海市实验教学示范中心9个；有国家级教学团队8个，上海市教学团队15个；有国家级教学名师8人，上海市教学名师36人；有国家级精品课程46门，国家级视频公开课12门，国家级精品资源共享课程23门，上海市精品课程142门；有国家级双语示范课程7门，上海高校示范性全英语课程10门。

学校现有一级学科博士学位授权点36个，覆盖经济学、法学、文学、理学、工学、农学、医学、管理学等8个学科门类；一级学科硕士学位授权点57个，覆盖全部13个学科门类；博士专业学位授权点3个；硕士专业学位授权点23个；32个博士后流动站；1个国家实验室（筹），8个国家重点（级）实验室，5个国家工程研究中心，3个国家工程实验室，2个国家级研发中心，1个国防重点学科实验室，3个协同创新中心，1个国际联合实验室，16个教育部重点实验室，4个卫生部重点实验室，1个农业部重点实验室，31个上海市重点实验室，5个教育部工程研究中心，7个上海市工程技术研究中心，1个国家社科基金决策咨询点，2个文化部文化产业研究基地，8个上海市理论创新基地、智库和经济社会发展研究工作室，3个世界卫生组织合作中心，1个国家技术转移中心和1个国家大学科技园。

科学研究与科技创新水平不断提高。2016年，国家自然科学基金项目数和经费数连续五年全国第一。SCI收录论文数等指标连续多年名列国内高校前茅，2013年度SCI收录论文数4901篇，继续保持全国高校第二；2004-2013年SCI收录论文累积被引21694篇、234209次，继续保持全国高校第三；“表现不俗”论文1922篇，上升至全国高校第二；在各学科期刊影响因子前十分之一的期刊发文达到686篇，上升至全国高校第二；作为第一作者发表国际合著论文1058篇，上升至全国高校第二；在四大名刊发表论文9篇，居全国高校第三；在中国科学技术信息研究所公布的153种各学科高影响力期刊中发文188篇，名列全国高校第三；国内科技论文数7265篇，国内被引30177次，居全国高校第二。