学院的学科专业建设及科研攻关位居国内同类院校前列。1986年成为全国体育学科首批博士学位授予单位，拥有体育学一级学科和下属所有4个二级学科的博士学位授予权，其中民族传统体育学为全国唯一的博士点，是全国唯一一所体育学下属所有二级学科都具有博士学位授予权的院校。9个硕士专业，有新闻学、运动医学、应用心理学(一级学科)三个跨学科门类的硕士学位授予点。拥有1个博士后流动站、1个教育部重点(培育)学科、6个国家体育总局重点学科、3个上海市重点学科;3个国家级特色专业、3个上海市级特色专业;1个国家级实验教学示范中心、1个上海市级实验教学示范中心;2门国家级精品课程、10门上海市精品课程、30门上海市教委重点建设课程;1个国家级教学团队、2个上海市级教学团队和4名上海市级教学名师、3个上海市教育高地和多个高水平特色项目。

在上海市人民政府和国家体育总局各级领导的高度重视和关心下，于2010年9月揭牌成立由国家体育总局与上海市人民政府共建的上海体育学院中国乒乓球学院，着力培养具备国际视野、卓越才能、创新精神的乒乓界精英。

在未来发展中，学院将以科学发展观为统领，围绕体育强国、高等教育强国、人力资源强国战略，结合上海率先实现教育现代化与建成社会主义现代化国际大都市的目标，聚焦“发展、质量、特色”三大主题，着眼师生终身发展，坚持立足体育、依托上海、服务全国、面向世界的定位，以体育学科为主干、本科教育为基础，加强高水平竞技人才培养，努力建设世界一流体育大学。