学校重视科学研究，实施“一流学科建设计划”、“1355科技创新工程”，不断强化优势特色，提高科技创新能力。建有2个省级重点学科、4个省文化艺术科学重点学科。建有校级科研机构12个，拥有1个国家级科普教育基地、9个省部级重点实验室（研究中心、基地）、3个省级(社)科普教育基地、3个省高校重点实验室（基地）和22个市厅级创新平台。承担国家级科研项目40项、省部级科研项目360项；获得专利授权467项，取得鉴定成果70项；获市厅级以上科研成果奖励1569项。发表学术论文5600余篇，其中SCI、EI收录481篇；出版学术著作161部。《滨州学院学报》被评为“全国地方高校名刊”，“孙子研究”栏目入选教育部“名栏建设工程”。

学校积极开展社会服务，主动对接“一带一路”“两区两圈”和“民航强国”等发展战略，制定实施《服务黄河三角洲区域发展行动计划（2016-2020年）》《服务民用航空业行动计划（2016-2020年）》，与山东社会科学院、滨州市政府、青岛科技大学、山东理工大学、青岛国际机场、济南机场、东营胜利机场签订战略合作协议。建有黄河三角洲高效生态经济发展研究院等一批服务区域、行业发展的创新平台，与地方政府、企业、行业签订合作协议100余项，合作项目600余项，服务经费1000余万元；与地方、行业联合培养培训各类急需人才35000余名。

学校坚持引育并举，实施“三百工程”、“黄河英才工程”、“1121人才工程”、“‘双师双能型’教师素质提升工程”，大力加强人才队伍建设。现有专任教师864人，其中，博士生导师4人、硕士生导师41人，教授、副教授253人，博士、硕士748人；有国家“千人计划”特聘教授1名、享受国务院政府特殊津贴1人、山东省有突出贡献的中青年专家1人、山东省教学团队4个、山东省教学名师7人、山东省优秀教师6名、山东省高校首席专家2人。聘请8名院士担任学校名誉院长、顾问或客座教授，聘任兼职教授和具有丰富实践经验的兼职教师180余人。