学校有临床医学、基础医学等2个硕士学位授权一级学科点，口腔临床医学、中西医结合临床等27个硕士学位授权二级学科点，临床医学、口腔医学等2个硕士专业学位授权点。现有医学免疫学、口腔科学、临床营养支持中心（肝胆外科）、内科学、人体解剖与组织胚胎学、病理学与病理生理学、临床营养与代谢实验室等7个省级重点学科（实验室）；病理学、组织学与胚胎学、儿科学等3门省级教学改革试点课程；组织学与胚胎学、病理学、生物化学、药理学、病理生理学、生理学、外科护理学、内科护理学等8门省级精品课程；临床技能实训中心、口腔医学实验教学中心等2个省级实验教学示范中心；医学免疫学为省级双语教学示范课程。

科学研究近五年来，学校共承担各类科研课题1083项，其中国家级19项，省部级121项，厅局级135项；科技成果获省部级奖励6项，厅局级奖励263项；获省级教学研究成果奖7项；出版专著、教材266部，发表论文2789篇，其中被SCI等收录和转载500余篇，核心期刊1020篇。

主办中国医学统计类核心期刊《中国医院统计》和中国学术期刊综合评价数据库来源期刊《滨州医学院学报》，均向国内外公开发行。

师资队伍学校现有教职工976人，其中专任教师685人。有教授91人，副教授226人，博士、硕士学位人员426人；全国模范教师1人、优秀教师4人，教育部新世纪优秀人才2人、高等学校骨干教师2人，享受国务院颁发政府特殊津贴人员4人，山东省中青年学术骨干和学科带头人培养对象16人、教学名师3人、优秀教师3人，省级教学团队3个。

办学设施学校现有滨州、烟台两个校区，占地1589.5亩，总建筑面积58万平方米；固定资产总值10.9亿元，教学科研仪器设备总值1.5亿元；图书馆藏书223万册；有直属附属医院1所，非直属附属医院10所，教学医院、实践教学医院130余所；教学实习用床位11000余张。学校直属附属医院建筑面积12.8万平方米，资产总值10亿元，仪器设备总值3亿元，开放床位1600余张，是鲁北地区医疗、教学、科研、保舰康复中心。

对外交流与合作学校坚持对外交流与合作，先后与美、英、日、韩、新西兰等国家的十余所高校建立了友好交流与合作关系，在人员交流、联合培养研究生、共建项目等方面取得丰硕成果。

近年来，学校先后获得全国特殊教育先进单位，山东省高校卫生科技教育工作、德育工作、教学管理、科研管理、实验室建设和管理、人事工作等先进单位，全国高校节能工作先进单位、全国城市节水基础管理工作先进校园，山东省校园管理、后勤工作、国防教育工作等先进单位等荣誉称号