学科专业学校有16个院（系），24个本科专业，涵盖医学、理学、管理学、法学、教育学、工学、文学7大学科门类，形成了以医学教育为主体，医学及医学相关学科协调发展、相互促进的学科专业特色。现有临床医学、公共事业管理、护理学、麻醉学等国家级特色专业4个，省级特色和品牌专业9个，省普通本科高校应用型人才培养专业发展支持计划建设专业2个。有省级精品课程群8个，省级精品课程46门。建有国家级临床医学虚拟仿真实验教学中心和3个省级普通高等学校实验教学示范中心。中国科学评价研究中心（RCCSE）、武汉大学中国教育质量评价中心和中国科教评价网共同发布2015版中国大学本科教育各专业排名，在全国43所开设麻醉学本科教育的高校中，我校位居第6名；在全国开设公共事业管理专业的346所高校中，我校位居第10。

学校现有服务国家特殊需求“公共卫生危机管理博士人才培养项目”1个。设有基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、生物学、护理学6个硕士学位授权一级学科，52个二级学科硕士点。

科学研究学校有省级重点学科（重点实验室）8个。外科学、人体解剖与组织胚胎学、影像医学与核医学、社会医学与卫生事业管理是省高校“十二五”重点学科，其中，人体解剖与组织胚胎学是省“泰山学者”设岗学科，外科学为特色重点学科。整形外科学、眼科学是山东省学科带头人设岗学科。整形与显微修复技术实验室是山东省重点实验室，应用药理学实验室、免疫学实验室、临床检验诊断学实验室是省高校“十二五”重点实验室，其中，应用药理学实验室为强化建设重点实验室。学校有医院统计学、卫生管理学等省医药卫生重点学科2个，临床麻醉实验室、生物药物实验室等省医药卫生重点实验室9个，省中医药重点学科（重点实验室）2个，省临床重点专科11个，省中医药重点专科1个。“健康山东”重大社会风险预测与治理项目为山东省高等学校协同创新中心自主培育建设项目。主办中国学术期刊综合评价数据库来源期刊《潍坊医学院学报》，向国内外公开发行。

师资队伍中国工程院院士谢立信、于金明为名誉院长。学校聘有泰山学者1人，泰山学者海外特聘专家5人，享受国务院政府特殊津贴10人。有全国模范、优秀教师8人，省级教学名师8人，省市级专业技术拔尖人才32人，有博士研究生导师8人，硕士研究生导师596余人。有省级教学团队5个。应用药理学科研创新团队是山东省高校优秀科研创新（培育）团队。