学校不断强化科研的先导地位，加大科研投入，加强科研工作的激励和引导，科研水平不断提高，取得了丰硕的科研成果。近五年来，承担省部级以上科研课题1076项，其中国家社科基金、自然科学基金项目、教育部项目等国家级项目191项、省部级项目885项；获国家级、省部级科研奖励153项；被SCI、EI、ISTP和SSCI等检索收录论文793篇；获得科研经费17324.4万元，年均科研经费3464.8万元。有山东省政府规制与经济社会发展研究基地、山东省区域经济发展软科学研究基地、山东省财政金融研究基地、山东省公共财政制度与社会保障制度研究基地、服务业创新与发展软科学研究基地和山东省公共政策软科学研究基地等13个省级研究基地和研究中心，成立了区域经济研究院、经济研究中心、农业与农村经济研究中心等一批科研机构。

学校主办的《经济与管理评论》和《山东财经大学学报》，是国内外公开发行的综合性经济理论期刊，是中国人文社会科学核心期刊、全国城市经济十佳期刊、华东地区优秀期刊、山东省优秀期刊，在全国学术界具有较高的影响力。

学校实行开放式国际化办学的发展战略，与美国、英国、法国、加拿大、德国、荷兰、捷克、澳大利亚、新西兰等国家的100余所高校和教育机构在师生交流、科研合作、合作办学、联合培养等方面建立了多层次、多形式的交流合作关系。每年聘请长期外籍专家80余人，承担英语、德语、日语等语种以及部分专业课授课任务；学校于1993年获得招收留学生资格，现有来自美国、法国、荷兰、捷克、印度尼西亚、韩国等国家的语言留学生、学历本科留学生以及来自瑞典、捷克、巴西等国家的交换生。学校与美国明尼苏达大学、西敏大学、纽约州立大学奥维西布雷学院、哈特福德大学、佛罗里达国际大学、圣托马斯大学、纽海芬大学、英国龙比亚大学、英国埃塞克斯大学、英国普利茅斯大学、法国雷恩第一大学、加拿大达尔豪斯大学、新西兰Unitec理工学院、捷克布拉格经济大学、捷克布拉格城市大学、日本东京经济大学、台湾地区淡江大学、世新大学等国（境）外大学合作，每年选派500余名学生赴海外访学或本科就读研究生项目，实施本科、研究生双学位教育，增加学生的海外经历，培养具有国际化视野的复合人才。

学校与国内高校的交流与合作不断扩大，与山东大学、天津财经大学、山东师范大学、山东科技大学、山东省社会科学院等建立了全面合作关系，每年选送部分优秀研究生、本科生到山东大学和天津财经大学等高校相关专业进行为期半年或一年的访问学习。