学校现设有人文社科学部、理工学部和医学部，拥有12个学科门类的119个本科专业，2个国家重点学科，1个国家重点（培育）学科，8个学术类博士学位授权一级学科，45个学术类硕士学位授权一级学科，1种博士专业学位授权和18种硕士专业学位授权，11个博士后科研流动站。学校设有5所附属医院，共有9个国家临床重点专科。学校化学、临床医学、农业科学（食品科学与工程为主）、工程学4个学科进入美国ESI排名前1%。1篇博士论文入选全国优秀博士学位论文，实现了江西省“全国百篇优博”零的突破。在全国第三轮一级学科整体水平评估中，食品科学与工程学科位列全国同类学科第4名。

学校是教育部普通高校本科教学工作水平评估优秀高校，具备扎实的办学基础。现有1个国家级教学团队，1门国家级双语教学示范课程，7门在线开放课程，2门国家级精品课程，6门国家级精品资源共享和视频公开课，3个国家级专业综合改革试点项目，9种“十二五”国家级规划教材，9个国家级特色专业，2个国家级虚拟仿真实验教学中心，5个国家实验教学示范中心，2个国家级大学生校外实践教育基地，4个国家级工程实践教育中心，14个国家级卓越人才教育培养计划专业。学校是教育部中国教育和科研计算机网（CERNET）江西主节点单位，是江西唯一一所参与中国下一代互联网示范工程CNGI建设的高校。《南昌大学学报》分文、理、医、工科版，其中文、理科版为中文核心期刊，医、工科版为科技核心期刊。

学校现有1个国家重点实验室，1个国家工程技术研究中心，1个教育部人文社会科学重点研究基地，2个教育部重点实验室，3个教育部工程研究中心，9个江西省协同创新中心。2015年，学校获批国家自然科学基金项目199项（位列全国申报单位第30名）；国家社会科学基金22项（位列全国高校第36名），其中国家社科基金重大项目2项，国家艺术基金项目1项。

学校协同创新能力不断增强，取得了一批原创性、标志性、有特色的科研成果。其中，硅衬底高光效GaN基蓝色发光二极管项目摘得2015年度唯一国家技术发明一等奖，这是自国家科学技术奖设立以来，首次由地方高校获得的一等奖，正助推江西打造“南昌光谷”。学校还与政府、企事业单位开展全方位、多层次的合作，促进科技成果转化，推进政产学研用紧密结合。