学校现设有本科专业24个，涵盖医、理、工、文、经、管六大学科门类，拥有博士学位授权一级学科点2个，学术型硕士学位授权一级学科点4个，学术型硕士学位授权二级学科点36个，专业型硕士学位授权类别4个，省级示范性硕士点2个。拥有国家中医药管理局重点学科18个、省级高水平学科2个、省级“十二五”重点学科3个，国家级特色专业3个，江西省级特色专业7个，江西省专业综合改革试点项目6个，国家临床重点专科（专病）7个、国家中医药管理局重点专科（专病）12个。

学校倡导并践行“赢在终点”为核心的教育理念，引领人才培养模式改革与创新，先后开展了科研实践班、双惟实践班等一系列教育教学改革实践。拥有国家级人才培养模式创新实验区1个，国家级高等学校实验教学示范中心1个，国家级大学生校外实践教育基地1个，国家级本科专业综合改革试点1个，教育部高等学校特色专业建设点3个，国家级精品课程2门，国家双语示范课程1门，国家教学团队1个，教育部、国家中医药管理局卓越医生（中医）教育培养计划改革试点项目2个。两项教学改革研究项目分别于2001年、2009年获得教育部国家教学成果二等奖。，刘红宁教授牵头主持的“新时期高等中医药院校‘基础素质’教育理论创新与‘双惟模式’实践”获得国家级教学成果一等奖，率先在江西省高等院校中实现该奖项零的突破。学校近三年毕业生就业率、考研升学率名列全省本科院校前列。

学校始终坚持以推动中医药事业进步为使命，在中药药剂、针灸推拿等学科领域形成了突出优势。研发的中药制药系列关键技术和设备被100多家企业采用，产生了良好的经济社会效益。原始创新成果——“热敏灸”理论和技术，揭示了针刺穴位和灸疗穴位的差异，开创了内源性热敏调控治疗疾病的新途径，显著提高了艾灸的临床疗效，有力缓解了老百姓看病难、看病贵的难题，成为国家行业建设标准并在上海世博会上向全球推广，开创了“北看天津针、南看江西灸”的格局。“热敏灸技术的创立及推广应用”获国家科技进步二等奖，是我校也是江西医学领域首次以第一完成单位获得该奖项，填补江西医学领域空白。

学校拥有3个国家级科研平台，其中，国家工程研究中心2个（中药固体制剂制造技术国家工程研究中心、中蒙药丸剂关键技术及工艺国家地方联合工程研究中心）、国家企业重点实验室1个（创新药物与高效节能降耗制药设备国家重点实验室）；有教育部重点实验室等31个省部级科研平台。近5年，共承担省部级以上项目493项，年均科研经费5237.24万元；获得国家发明专利授权43项、计算机软件著作权3项；有29项成果获省部级以上奖励，其中国家科技进步二等奖2项、省级科技进步一等奖3项。