近年来，学校承担了一大批国家层面重点、重大研究计划和重点、重大工程科研项目。如国家自然科学基金、863计划、973前期专项、948项目等国家层面科技计划项目；三峡、南水北调、小浪底、长江口航道治理、淮河入海水道、二滩、溪洛渡、龙滩等重大水利、水电工程项目；南京地铁、沪宁高速公路、广东汕汾高速公路、南京长江二桥、润扬长江大桥等重大交通工程建设项目。其中一批科研成果取得重大突破，达到国际先进水平，获国家级科技成果奖20项，部省级科技成果奖265项。

河海大学具有广泛的国际交流与合作，是国家首批授权可授予外国留学生博士、硕士、学士学位的学校，与美、英、法、俄、德、荷、澳、日及香港等国家和地区的70多所大学、科研机构建立了合作关系。经教育部批准，2013年起，河海大学与英国阿伯瑞斯特维斯大学开展合作办学，招收环境科学专业学生。此外，学校与法国里尔科技大学、法国杜埃矿业学院、澳大利亚新南威尔士大学等国外知名大学均有长期合作，每年派出百余名学生前往攻读博士或工程师学位。河海大学还是“国家建设高水平大学公派研究生项目”60所签约高校之一，国家留学基金委根据协议每年资助60名河海大学优秀学生到国外一流高校攻读博士学位。

建国以来，河海大学为我国社会主义现代化建设培养了10多万高级技术人才和管理人才。在毕业生中，有成绩突出的两院院士，有党政岗位的重要领导，有功勋卓著的共和国将军，有业绩显著的企业家，还有大批奋斗在第一线的专业骨干。学生就业率长期保持在96%以上，居于全国高校前列。2005年，以优秀的成绩通过教育部本科教学工作水平评估。研究生教育规模快速发展，研究生培养质量持续提高，已建成具有水利特色的高层次人才培养和知识创新的基地。

河海大学的发展得到了党和国家的重视和关怀。1995年80周年校庆，江泽民同志为学校题词：“面向未来，开拓进取，进一步发展水利教育事业”，李鹏、李岚清、钱正英等党和国家领导人也为学校题词；2005年90周年校庆，温家宝总理视察学校并作重要讲话，以“献身、求实、负责”的水利精神对学校寄予了殷切期望。继往开来的河海大学正向着高水平特色研究型大学迈着坚实脚步。