学院以区域发展和行业发展需求为导向，创新育人模式，强化实践教学环节，推动教学改革，培养高素质应用型人才。实施因材施教、分层次（机类、电类工科基础强化班、高等数学和大学英语分级教学）、多渠道的人才培养模式，为学生丰富知识、培养才干、锻炼能力提供充分的空间和舞台。学院教育教学质量高，针对优秀生的各种培养措施得力，学生在各类国家、省级学科专业竞赛与创新制作大赛中成绩优秀，获奖人数和奖项等级，以及毕业生的就业率、考研率、出国深造率均在同类院校中名列前茅，在社会上享有良好声誉。2011届毕业生就业率为96.65%；2012届毕业生就业率达到97.03%，其中，协议就业率达到92.94%，2013届毕业生就业率为97.11%，2014届毕业生就业率为97.25%
2010年，南航金城学院获得全国“首届中国创新榜样”荣誉称号和全国“先进独立学院”荣誉称号。2011年11月，南航金城学院获得江苏省“最受欢迎的独立学院”荣誉称号。2012年4月，作为江苏26所独立学院的杰出代表，中国民办教育研究院江苏分院落户南航金城学院。2015年2月，南航金城学院获得江苏省江苏省民政厅授予的“5A级社会组织”，是唯一一家获得5A级的全省性民办非企业单位，也是全省第一所获此殊荣的独立学院。2015年5月，南航金城学院被授予“江苏省五一劳动奖状”，这也是迄今为止江苏省第一所被授予此殊荣的独立学院。