学校始终坚持以学科专业建设为龙头，以“强化应用、注重创新、交叉融合、彰显特色”为专业建设指导方针，现有传媒学院、商学院、外国语学院、信息科学与工程学院、化学与生命科学学院、城市与资源学院、艺术学院等7个二级学院，下设27个系、40个专业和69个专业方向，涵盖文理工经管艺，形成多学科并举的局面，并培育了一批品牌特色专业，历次参加全省同类院校专业建设抽检均获第一。学校还策划了一系列重要学术活动，以增强在各个学科领域的国内外影响：南京大学110周年校庆期间，成功举办首届华语大学生微电影节、中国水中机器人大赛暨首届国际水中机器人公开赛等重要活动，中央电视台、人民网等主流媒体竞相报道，引发社会热烈关注。在接收南京大学一批国家级实验教学示范中心的基础上，学校投资数千万兴建了媒体融合、同声传译、现代通信技术、护理学、虚拟城市等一批理念先进的现代化实验室，建立了200余个政产学研平台和校内外实习实践基地，并与中国联通、江苏淮化、上文国际等知名企业深度开展校企合作。

学校每年投入专项经费组织开展教学改革，“十一五”、“十二五”期间承担多项国家课题立项项目和教育部教育改革创新项目，出版了《工程数学》等20余部适应应用技术型大学人才培养的精品教材。学校承担了江苏实施国家教育体制改革试点的“全面学分制改革”项目，充分借鉴南京大学“三三制本科人才培养模式改革”的成功经验，在优质课程资源等方面共建共享，实现学生的个性化发展，改革工作得到省教育体制改革领导小组的充分肯定。与此同时，科学研究工作深入推进，纵向、横向科研项目均取得可喜进展，由艺术学院主创的2013年南京市重点文化工程之一——老城南记忆馆展陈设计，得到市领导与专家的高度评价；同年11月，传媒学院制作的微纪录片《孙明经：远去的金陵背影》亮相第八届巴黎中国电影节，凭借充沛的人文情怀和冷峻的历史表达，获得最佳文献纪录片奖。

学校始终坚持以队伍建设为核心，精心打造了一支师德高尚、业务精湛、结构合理、充满活力的高水平教师队伍，众多教学名师与知名学者耕耘在教学第一线，由南京大学资深教授组成的教学督导委员会全面指导学校的教学工作，与广大教师共同维护着教学质量生命线。在引进高水平学科带头人的同时，学校采取多元化培养举措，一批优秀青年教师迅速成长，多人入选江苏高校“青蓝工程”和“南京人才321计划”。随着南京大学优秀教师、双师型师资和外籍教师的加盟，学校师资队伍不断优化。秉承南京大学的优良传统和人文精神，学校开设名家讲坛，每年举行高水平讲座近百场，两院院士、知名学者和业界名家、社会名流以学术风范和人格魅力感染着莘莘学子。一批南京大学中青年管理骨干构成了学校管理层的中坚力量，他们开拓创新，锐意进取，学校事业得以青蓝相继、薪火相传。