南京大学在1952年院系调整前长期是中国高校中院系最多、门类最齐全、师资力量最强、规模最大的一所大学，院系调整中被分拆出大量系科，元气大伤。改革开放后南京大学实力上升明显，一度排进大陆高校前3位。在20世纪90年代末及21世纪初全国高校合并浪潮后至今，南京大学的综合实力排名稳定维持在大陆高校第3-7位、世界160-300位。南京大学在未合并任何高校，整体规模较小的情况下取得这一成绩非常难得。（图册：[23][39]）
最新权威排名结果：

世界三大最具影响力的全球性大学排名：
1、QS世界大学排名（2012-2013年）：南京大学位列世界第168位，中国大陆第5位；[40]QS亚洲大学排名（2016年）：南京大学位列亚洲第26位，中国大陆第5位。[41]
2、泰晤士高等教育世界大学排名（2012-2013年）：南京大学位列世界第251-275位（区间），中国大陆第5位。[42]
3、世界大学学术排名（2012年）：南京大学位列世界第201-300位（区间），中国大陆5-7位（区间）。[43]

最新民间排名结果：
网大中国大学本科教育排行榜（2013年）：南京大学位列综合排行榜第5，学术资源第6，教师资源第2。本科教育综合实力第2，本科师资力量第1，本科课程第1，本科校友捐赠第1。
武书连2013中国大学排行榜（2013年）：南京大学位列综合排行榜第6，一流大学排行第2，教师水平第2，教师绩效第1，毕业生质量第