“十一五”以来，学校主持国家及省部级纵向课题749项，在国内同等院校中承担项目数和经费数均名列前茅。其中，2010年获国家“重大新药创制”科技重大专项项目数40余项，经费资助2.15亿元，获批项目数、经费数均居全国高校之首。

服务社会能力不断提升，成立了国家药物政策与医药产业经济研究中心、连云港研究院，与多个省市区政府签订合作协议，与国内一批著名医药集团建立战略合作联盟，一大批科研成果已转化为生产力。“十一五”以来，我校共申请专利750项，获得授权发明专利409项，11个新药获得临床批文，9个新药获取国家新药证书。在核心期刊发表论文5375篇，其中3100篇论文被SCI、EI收录。获国家科技进步一等奖1项、国家科技进步二等奖3项、省部级科技进步奖27项。近十年来，我校与1000余家医药企业签订了8457项合作协议，2项技术转让单个合同经费突破1亿元。

交流合作　学校是教育部最早指定接收药学学科外国留学生、进修生、高级访问学者的基地，也是接受华侨、港澳台地区学生的定点院校之一。为世界57个国家培养博士、硕士、本科生和进修生；与23所国外和境外大学建有姊妹学校关系，与27个国家的大学和科研院所签订有校际学术交流协议；与40多个国家和地区的有关院校及科研机构建立了学术联系。2011年，诺贝尔医学和生物学奖获得者、美国著名药理学家路易.伊格纳罗受聘为我校荣誉教授，并与我校合作建立伊格纳罗工作站。2016年，学校与英国斯克莱德大学（UniversityofStrathclyde,Glasgow）合作举办药学专业本科教育项目获教育部批准。

70余年来我校培养了6万多名高素质的药学专门人才，孕育了一批药学界的名家大师，如中国科学院首批学部委员，我国中医药界的一代宗师，著名中医中药学家叶桔泉；中国工程院院士，我国化学制药、药物化学专业创建人之一，著名药物化学家彭司勋；中国科学院院士，我国生药显微鉴定的奠基人，著名生药学家徐国钧；中国科学院院士，为我国“两弹一星”研制作出重要贡献的著名有机化学家袁承业；中国工程院院士，我国医药工业现代化生产技术开发的先驱者之一，著名药物化学家沈家祥；中国科学院院士，著名植物资源与植物化学家周俊；中国工程院院士，我国中药生物技术的开拓者，著名中药生物工程专家胡之璧；成功研制出3个意义重大的创新药物的著名药物化学家谢晶曦；著名生药学家和本草学家谢宗万；我国甾体药物研发领域开拓者之一，著名药物学家廖清江；我国第一位执业药师，著名药剂学家刘国杰；我国药物分析学科的主要倡导者，著名药物分析学家安登魁等。