河海大学校本部位于南京市鼓楼区，在常州市新北区、南京市江宁区设有校区，总占地面积2300余亩。

河海大学设有水文水资源学院、水利水电学院、港口海岸与近海工程学院、土木与交通学院、环境学院、能源与电气学院、计算机与信息学院、机电工程学院、物联网工程学院、力学与材料学院、地球科学与工程学院、理学院、商学院、企业管理学院、公共管理学院、法学院、马克思主义学院、外国语学院、体育系等专业院系和大禹学院（拔尖人才培养学院）。学校拥有1个一级学科国家重点学科（水利工程），7个二级学科国家重点学科，2个二级学科国家重点学科培育点，10个一级学科省级重点学科，50个二级学科省级重点学科；6个国家级以及省部级重点实验室，10个国家级以及省部级工程研究中心；12个博士后流动站；12个一级学科博士点，66个二级学科博士点；35个一级学科硕士点，198个二级学科硕士点；11种硕士专业学位类别，其中工程硕士专业学位涉及18个工程领域；51个本科专业。水利工程、土木工程学科综合实力处于全国领先位置，水利工程学科总体实力最强，支撑及相关学科门类众多。2013年，各类学历教育在校学生46921名，其中研究生14750名，普通本科生19871名，成人教育学生11998名，留学生302名。

河海大学现有教职工3409名，具有高级职称的教师1079名，博士生导师364名；现有中国工程院院士2名，双聘院士15名。“中组部海外高层次人才引进计划(千人计划)”入选者8名，教育部“长江学者奖励计划”特聘教授6名、讲座教授1名，国家杰出青年科学基金获得者7名,“国家级教学名师奖”获得者3名，国家级有突出贡献的中青年专家8名，“百千万人才工程”国家级人选9名，教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者23名，江苏省有突出贡献中青年专家9名，入选江苏省“333高层次人才培养工程”、江苏省高校“青蓝工程”等省级人才计划培养对象近300人次。“长江学者和创新团队发展计划”创新团队5个、“江苏高等学校优秀科技创新团队”3个、“青蓝工程”科技创新团队5个。