2003年3月，温州市鹿城区人民检察院在处理温州铁路房地产开发公司副总经理杨光荣（杨秀珠弟弟）受贿案时，发现杨秀珠于1994年贪污1100多万元人民币。
曾藏身荷兰一个地下室
2003年4月20日，当时任浙江省建设厅副厅长的杨秀珠携女儿、女婿及外孙从上海机场途经新加坡出逃美国。2003年5月13日，浙江省对杨秀珠立案侦查。2003年6月23日，浙江省委批准开除杨秀珠党籍，浙江省政府批准撤销杨秀珠行政职务，检察机关发出逮捕令。2004年2月，浙江省检察机关通过国际刑警组织，发出了红色通缉令。杨秀珠出逃后辗转新加坡、美国、荷兰等多个国家，最后藏身于鹿特丹市一个阴暗潮湿的地下室里惶惶不可终日。2005年被捕前，她时常一个人绝望地哭泣。当荷兰警察宣布对其实施拘捕后，她的情绪反而平静下来。2011年6月28日，杨秀珠的司机杨胜华归国投案。
据温州市纪委2004年的通报，杨秀珠已被查清的涉案金额为2.532亿元人民币。已追回金额4240多万元人民币，冻结7000多万元人民币的资金或房产。已立案查处的涉案人员中，厅级官员2人、处级以上官员11人、科级官员7人，被调查取证的有100多人，并牵涉相关经济案件12起。