金瓶掣签制度确认了班禅转世灵童的产生办法，即按宗教仪轨，由有关寺院和地方政府寻访灵童，再对访到的众灵童逐一筛选，被确定下来的灵童人选的灵异情况等禀报皇帝，请求准予金瓶掣签认定。皇帝恩准后方可择日在释迦牟尼像前由驻藏大臣主持掣签，认定转世灵童。而后由驻藏大臣上奏皇帝，请求任命。皇帝批准后，由中央政府派大员前往看视并主持坐床大典。金瓶掣签是中央政府对西藏行使主权的重要组成部分，是清王朝为整治流弊、护卫黄教、使活佛转世制度得到必要的整顿而制定的万世遵循的具有最高法律效力的制度。它符合宗教仪轨，体现了释迦牟尼的法断，同时还有助于杜绝营私作假的流弊、弘扬正法、避免纷争。
灵童
金瓶掣签制度一经颁布即得到了达赖喇嘛、班禅额尔德尼及各呼图克图、僧众的衷心拥护。金本巴瓶制成送往拉萨后，八世达赖喇嘛表达了对清中央政府的感激之情，他说：特颁金本巴瓶，钦差御前侍卫等赍送，护卫佛门，实已无微不至，我实感戴难名。嗣后唯有钦遵圣训，指认呼毕勒罕（转世者）时虔诚诵经，于大众前秉公拈定，庶使化身正确，宣扬正法，远近信心，阖藏僧俗顶戴天恩，无不感激。七世班禅丹白尼玛也称此次钦差大人送金本巴瓶来藏，全为保护黄教，实在感激天恩，无可图报，惟有率领众喇嘛，崐虔诵万寿经，祝延圣寿。对中央政府的册封，九世班禅曾写信给当时的中华民国总统，表达感激之情：蒙大总统加封至忠阐化名号，谨在扎什伦布寺内，恭设香案，敬叩祗领跪谢。十世班禅大师是金瓶掣签制鹊募岫拥护者。他在圆寂前四天曾言及我想在释迦牟尼像前，采取‘金瓶掣签’的办法来确定，体现了大师继承祖制、坚持金瓶掣签的决心。
至此，金瓶掣签成为一项必须遵守的国家法规和宗教仪轨，它对于顺利实现宗教权力的传承和延续、对于维护西藏地区的稳定和发展、对于保证中央政府在活佛转世问题上的最高权威，均具有重大意义。
金瓶掣签制度形成后，掣签大权一直掌握在中央政府手中。在具体实施过程中，其形式或细节后来有所变通，但活佛转世、尤其是达赖、班禅等大活佛转世必须经中央政府批准，否则即视为非法已成定例。民国时期，内乱频仍，外患不绝，中央政府孱弱，但达赖喇嘛和班禅额尔德尼仍是由中央政府册封的。七世、八世班禅转世灵童及九世、十世、十一世达赖转世灵童均由中央政府主持金瓶掣签认定。由于特殊的历史条件及其它诸多因素的作用，九世班禅转世灵童是免于掣签确认的，但仍是经中央政府特许的。无论是否掣签，最后决定权在中央，其他任何人均无权决定。
活佛转世真实纪录片：