学校现设有临床医学院、护理学院、药学院、检验医学院、康复医学与保健学院、基础医学院、公共课部、思想政治理论课部(人文社会科学部)、继续教育学院（高等职业教育学院）和第一临床学院等10个二级教学院部；有民族医药研究中心、生物医学研究中心等2个校级科研机构，侗医药研究湖南省重点实验室1个。学校是国家执业医师临床技能考试基地。

学校现有医学、理学、管理学3个学科门类，开设临床医学、护理学、药学、医学检验技术、医学影像技术、康复治疗学等6个本科专业和临床医学、口腔医学、医学影像技术、护理、助产、药学、药品经营与管理、医学检验技术、卫生检验与检疫技术、针灸推拿、医学美容技术11个专科专业。

学校有国家级重点建设专业2个（临床医学专业、护理专业），省级重点专业1个（药学专业），省级特色专业2个（护理专业、医学检验技术专业），省级专业综合改革试点专业1个（医学检验技术专业），湖南省普通高校实践教学建设项目2个（大学生创新训练中心，校企合作人才培养基地），省级优秀教学团队1个（基础医学系列课程教学团队），国家精品课程1门（病理学与病理生理学），省级精品课程5门（人体解剖与组织胚胎学、生理学、天然药物化学、生物化学检验、微生物学检验），省级示范实验室2个（人体机能实验中心，医学检验实验中心），省级实践教学示范中心1个（临床技能实训中心）。

学校先后获得“全国卫生系统先进单位”、“全国五四红旗团委”、“湖南省文明标兵单位”、“湖南省文明高等学校”、“湖南省就业创业示范校”、“湖南省辅导员工作研究与实践先进单位”、“全省高等学校学生军训工作先进单位”、“怀化市文明红旗单位”、“怀化市先进基层党组织”等荣誉。