2006年以来，学校共承担各级各类科研项目7320项，其中“973计划”、“863计划”、国家科技支撑计划、国家自然科学基金、国家社会科学基金、国家软科学研究计划等国家级项目265项，省部、市级项目1390项。获国家、省部、市级教学、科技成果奖160项，其中，国家科技进步二等奖2项，国家技术发明奖二等奖1项，国家教学成果二等奖1项，湖北省科技进步一等奖、湖北省教学成果一等奖等省部、市级科技奖励156项。获专利授权1490余项。教职工发表的学术论文被SCI、EI、ISTP、SSCI、CSSCI、新华文摘、人大复印报刊资料等检索收录3460余篇。学校机器人足球队连续多年共荣获10余项世界机器人足球大赛冠军。2014--2016年，学校科研入帐经费共计3.9亿元，科研经费增幅居省属高校前列。学校科技产业园和科技孵化器大楼均已投入使用，学校被评为“科技服务湖北先进单位”、“武汉市科技管理先进集体”。学校主办《武汉工程大学学报》、《化学与生物工程》等科技核心期刊。

学校十分重视对外交流与合作，先后与英国朴茨茅斯大学、谢菲尔德哈勒姆大学；美国杜克大学、佛罗里达理工学院、密苏里大学哥伦比亚分校、路易斯安纳大学、印第安那州立大学、韦恩州立大学、拉文大学、拉塞尔大学、加州大学河滨分校、石溪大学、贝瀚文大学、柴恩大学；法国梅兹国立工程师学院、瓦朗谢纳大学、图卢兹二大、洛林大学、兰斯大学；澳大利亚桑瑞亚学院、拉筹伯大学、科廷大学、昆士兰科技大学、西澳大学；加拿大渥太华大学、莫哈克文理学院；马来西亚沙巴艺术学院；新加坡义安理工学院；吉布提大学等40余所大学或研究机构建立了稳定的学术交流和合作关系，展开了一系列合作办学、学生交换，师资互访，共同科研等多方面的合作，其中中外合作办学项目11个；每年有100余名国外专家、学者应邀来校讲学、访问。学校先后派出各类人员200多人次分赴20多个国家和地区的高校或研究机构交流、访问、留学、进修及参加国际学术会议，进行科研合作等。学校与丹麦Alfa Laval公司联合培养研究生。学校自具备招收留学生的资格起，已招收来自哈萨克斯坦、巴基斯坦、孟加拉、津巴布韦、埃塞俄比亚、肯尼亚、赞比亚、喀麦隆等国的留学生，分别就读于我校土木工程、机械工程、电气工程等专业，以及法国、加纳、巴基斯坦、马达加斯加等国的研究生。学校与南京工业大学、河北科技大学、青岛科技大学等国内高校长期开展校际互换生工作。