学校现有科技部中医药国际科技合作基地1个，黑龙江省中医药国际科技合作基地1个，黑龙江省科技创新平台1个，黑龙江省工程技术中心1个，教育部省部共建重点实验室1个，国家中医药管理局重点研究室3个，国家中医药管理局三级实验室10个，省重点实验室3个，省普通高等学校重点实验室4个，黑龙江省科技创新团队1个。“十五”以来，获得各级各类科研课题立项1309项，其中国家“973”项目3项、“863”项目1项；获得各级各类奖励419项，其中：国家技术发明二等奖1项、国家科技进步二等奖6项；高校自然科学一等奖1项、中华中医药科技进步一等奖2项、黑龙江省科技进步一等奖5项。在中药血清药物化学研究、中药天然药物药效物质基础研究方面处于国际先进水平，在方剂配伍规律、针灸作用机理研究和中医药治疗内科、妇科、肾病等重大疾病的临床研究方面处于国内领先水平。2008年，学校培养的博士撰写的论文获得教育部、国务院学位委员会“全国优秀博士学位论文”，2009年又获“全国优秀博士学位论文提名论文”，成为全国第三个获此殊荣的中医药大学。

学校附属第一医院（临床医学院）为国家中医临床研究基地建设单位、国家三级甲等医院、全国示范中医医院、全国医药卫生系统先进集体，全国三八红旗先进集体。学校附属第二医院（针灸推拿学院）是以针灸推拿康复为特色的三级甲等医院，为全国首批现代化中医院建设单位。两附院有国家级医疗中心和重点专科7个、省级医疗中心和重点专科11个。

学校现有教职工2486人（校本部1117人）。其中教授、副教授及相应职称人员685，博士研究生导师92人，硕士研究生导师219人，有38位专家享受政府特殊津贴，卫生部有突出贡献中青年专家3名，百千万人才工程国家级人选4人，国家级教学名师3名，全国巾帼建功标兵1名，全国优秀工会干部2人，全国优秀教师6名，在职全省劳动模范4人，省女职工建功立业标兵岗1个，建功立业标兵2名，全省五一劳动奖章1名，药学院和学校先后获得省五一劳动奖状。。现有长江学者讲座教授1人，龙江学者特聘教授6人。中药化学教学团队、方剂学教学团队、中医内科学教学团队、中药鉴定学教学团队被评为省级教学团队，中药化学教学团队和方剂学教学团队被确定为国家级教学团队。