学校附属第一医院（临床医学院）为国家中医临床研究基地建设单位、国家三级甲等医院、全国示范中医医院。学校附属第二医院（针灸推拿学院）是我省首家获得国家药物临床试验机构认定的中医院，为全国首批现代化中医院建设单位。两附院有国家级重点专科18个、省级重点专科23个。

学校现有教职工3043人（校本部1169人）。其中教授、副教授及相应职称人员929名，博士研究生导师114人，硕士研究生导师375人，有41位专家享受政府特殊津贴，卫生部有突出贡献中青年专家3名，百千万人才工程国家级人选4人，国家级教学名师3名，全国先进工作者1名，巾帼建功标兵1名，全国优秀教师6名。现有长江学者讲座教授1人，龙江学者特聘教授12人。国家级教学团队3个，省级教学团队5个，省教育厅科技创新团队6个。

学校拥有省内唯一一家药物安全性评价中心，建立了黑龙江省中药材GAP研究中心；为“省医药工业校企合作专业委员会”牵头单位，与多家企业合作，成立了黑龙江中医药大学久久药业和黑龙江宝泉制药有限公司等校企联合的科技实业；建成了占地100万平方米的黑龙江中医药大学清河中药材种子种苗繁育基地，并在黑龙江省14个市、县建成中药材GAP示范基地。

学校具有接收外国留学生和港澳台学生学历教育资格，是教育部首批批准招收来华留学生院校之一，已同世界上30多个国家和地区的近40所医学院校或研究机构开展了教育、医疗、科技合作与交流，目前学校长期国际合作项目139项，接受国外来访学者500多人，培养外国留学生及港澳台学生5000余人。多次承办大型国际学术会议，连续举办了十届“中俄药学论坛”、二届中匈双边医药学术研讨会及首次中德睡眠研究学术讨论会，开办“龙江中医讲坛”。我校与英国伦敦南岸大学、哈尔滨师范大学联合在英国伦敦创办的世界首家中医孔子学院连续四次被评为“优秀孔子学院”称号，2012年4月李长春出席我校中医孔子学院成立5周年庆典。

学校教学科研设备总值达1.98亿元，有超导核磁共振波谱仪、超高效液相质谱联用仪、电子显微镜（透射）、激光共聚焦扫描仪等一批大型精密仪器设备。学校图书馆藏书278万册，实现文献采集、借阅及检索自动化、网络化。中医药文献检索中心被确定为中国中医药文献检索分中心，实现了文献检索国际化。学校编辑出版的《中医药学报》、《中医药信息》、《针灸临床杂志》均为中国自然科学Ⅰ类期刊，均被收录为中国科技核心期刊。