校际合作：学校与郑州大学建立了紧密合作关系，在师资培养、专业发展、教学管理、科学研究、实验室建设等方面为学校提供支持和帮助。通过校际合作，既为基层培养了一批高层次卫生技术人才，又学习、借鉴了先进的办学理念和管理经验，锻炼了师资队伍，提高了教学、管理和服务水平。

2015年，学校与新乡医学院正式达成并签署了联合培养普通本科生的相关协议。计划招收口腔医学专业本科生50名，培养地点在商丘医学高等专科学校。这一计划已经得到省教育厅批准。我校目前已经启动了专业教师的遴选工作，并筹备做好新生在我校学习期间的教学、科研以及日常管理等各项准备工作。该协议的签订将加强校际间的合作与交流，提升我校人才培养水平，优化人才培养结构，进一步提高教育教学质量，推进我校医学教育事业的发展，为我校专升本工作奠定坚实的基础。标志着我校在专升本宏伟目标过程中迈出了重要一步。我校将以此为契机，大力加强内涵建设，为专升本目标而凝心聚力，奋力拼搏！

附属医院及教学医院：学校拥有3所集医疗、教学、科研于一体的附属医院。

第一附属医院（商丘市第一人民医院），是一所三级综合医院，建筑面积193424.74平方米。现有在职职工1895人，开放床位1485张，设有55个临床、医技科室。在职职工1895人，其中卫生专业技术人员1593人（高级职称220人、中级职称540人）。医院现有博士4人，硕士133人，享受国务院政府津贴2人，省学术技术带头人1人，省管优秀专家2人，省中青年科技创新人才2人，市级专业技术拔尖人才11人。　

第二附属医院（商丘市中心医院），总建筑面积3.8万多平方米，拥有正规病床520张，临床、医技科室46个，层流净化手术室6套，年门诊量40万人次。在职职工506人，其中医技人员435人，主任医师16人，副主任医师80人。主治医师150人，省级学术专业委员会委员12人，市级专业委员会主任委员、副主任委员26人。为保证临床教学和实践教学的需要,学校在全省42家医院建有教学实习基地，可满足2000余名学生的临床见习和毕业实习。