根据上述职责，市劳动保障局设8个职能科室。
(一)办公室
协助局领导处理机关政务；负责对外接待和劳动信息宣传工作；协调各科室及局直属单位工作关系；负责领导指示和会议决定事项的督办工作；负责文字综合工作；负责机关文秘、档案、保密、财务、保卫、后勤工作；负责局系统人事管理工作。
(二)规划工资科
研究制定全市劳动保障工作的中长期规划和年度计划；组织实施非国有企业工资总额宏观管理法规和政策；负责“工效”挂钩工作；实行与国民经济投入产出相联系的弹性劳动工资计划，宏观调控全市非国有企业职工人数和工资、总额；组织实施企业职工最低工资保障制度；确定劳动力市场工资价位，指导非国有企业改革内部分配制度；检查监督企业执行国家工资政策情况；负责全市劳动保障系统统计工作，定期提供统计信息。
(三)保险福利科
综合管理全市企业职工保险工作，制定社会保险发展规划和改革方案并组织实施；组织实施各项养老保险法规、政策，协调监督保险基金统筹工作；贯彻执行国家、省有关职工福利政策和标准，负责企业职工退休、工龄、工伤(亡)等有关待遇的认定审批工作。
(四)培训科
综合管理全市职业技能开发工作；制定职业技能开发总体规划、政策并组织实施；制定全市技工学校及社会力量举办的职业培训机构发展规划；综合管理各类职业技能培训机构和职业技能鉴定工作；管理工人技术岗位等级、转岗、学徒等培训及考核定级工作。
(五)法规科
负责劳动和社会保险法律、法规的宣传教育、咨询、培训工作；负责全市劳动执法、规范性文件的起草工作；负责制定劳动保障部门执法工作规划和普法规划；负责全市劳动保障行政执法部门行政执法情况的监督检查工作；指导全市劳动保障部门法制建设、行政复议和行政诉讼工作；组织重大行政处罚听证会，处理审批行政处罚等日常工作。
(六)社会保险基金监督科
负责对全市社会保险基金的征缴、管理、发放实施行政管理和监督检查；制定社会保险经办机构的管理规则和基金运营机构的资格认定标准；制定全市社会保险服务体系建设规划并组织实施；完成市社会保障监督委员会交办的任务。