学校以中医药、壮瑶医药研究为重点，加强科研创新基地与科技创新平台建设，教师积极开展科研活动，产、学、研、医紧密结合，为广西中医药千亿元产业提供有力的科技和智力支撑，促进了广西地方经济社会的发展。近三年来，学校获得的科技奖励国家行业一等奖2项、二等奖5项、三等奖2项；广西科学技术奖一等奖1项；广西科技进步奖二等奖8项、三等奖5项；广西科学技术发明奖三等奖1项；广西社会科学成果奖三等奖3项。“十二五”期间，学校获自治区教学成果奖一等奖3项、二等奖2项、三等奖10项；广西高校优秀教材奖7项；全国多媒体课件大赛一等奖3项、二等奖5项、三等奖1项；广西高校教育教学软件应用大赛一等奖11项、二等奖10项、三等奖12项。

学校拥有一批国家临床药理基地、国家中医药管理局中医药科研三级实验室、国家中医药管理局重点研究室、自治区金源单位、自治区重点实验室、协同创新中心、校地校企共建科技创新平台等，广西中医药科学实验中心是全国中医药民族医药最大的创新共享平台之一。韦贵康教授提出的“脊柱相关性疾病及颈性高血压学说”，邓家刚教授的“化学中药学说”，刘力红教授的《思考中医》以及唐农教授提创的“中医阴阳本体学说”，均在行业内具有广泛影响。学校尚活跃有中医“扶阳学派”、“八桂学派”、“黄氏壮医针灸”、“本土学派”等多个学术流派，形成了百家争鸣、百花齐放的学术氛围。

学校整体实力强，中医药、民族医药、中西医结合特色鲜明，有13所均为三级甲等的附属医院（其中直属附属医院2所，地方附属医院11所）,1所附设中医学校，1家校办制药厂。有重阳城老年公寓、元之源健康产业有限公司等一批在全国行业内有一定影响力的产学研基地和分布北京、天津等省区129个相对稳定的教学实践基地。

第一附属医院是广西最大的综合性省级中医医院、国家中医医院医疗质量监测中心广西分中心、全国中医医院中医药文化建设试点单位。医院与59个市、县级中医院、民族医院构建了广西最大的中医药技术帮扶网络平台。投资控股设立广西元之源健康产业有限责任公司。附属瑞康医院是广西最大的省级中西医结合医院，是国家中医药管理局国际交流合作基地，也是城市社区卫生服务技术指导中心。医院有西南地区乃至全国最为先进的肿瘤治疗设备——射波刀，中西医结合治疗肿瘤达到世界先进水平。第一附属医院与附属瑞康医院总床位数3438张。