金融业从原来缴纳5%的营业税改为缴纳6%的增值税，该行业营改增的难点主要来自于核心金融业务增值额难以确定，以及难以在服务接受方中分解。国际上一般不对金融业征收增值税。

此前中金公司首席经济学家梁红表示，因为金融服务的产品价格(利息)比较特殊，它不仅包括金融服务的增值部分，还包括资本价值、通货膨胀率和违约风险等其他因素，加之金融服务业务创新多，不易界定增值额范围，以至理论上难以计算出准确的增值额。

对于生活服务业来说，营改增后税负变化的关键在于，行业内企业以小微型企业和个体工商户居多，所面对的大部分是小型供应商，无法开具增值税专用发票。

不动产纳入增值税抵扣链条，一直被视为营改增中减税幅度较大的动作。楼继伟称，去年已经对有关方案进行认真研究和论证，听取了部门、有关协会和典型企业的意见，提出了改革方案。税率设计要简洁，要考虑企业的税负变化，还要兼顾财政的承受能力。

他表示，不动产纳入抵扣链条后，企业租来的房产、投资形成的不动产可以抵扣，但是过去以往的不动产还不能抵，新投资的部分可以抵，这恐怕在开始阶段可能有税负的变化，鼓励企业投资，甚至投资量大的时候，可能一两年可以不交税，都抵扣了。

不少专家学者认为，具有操作性的是采取分几年进行抵扣的方式。比如新建厂房投资1000万元，按照11%的增值税税率，进项抵扣税额110万元，需要分若干年抵扣，这样带来的财政减收压力会减小。

目前距离5月1日还有两个月，对于企业和财税部门来说，准备时间相对紧张。营改增之后，中央和地方财政收入都会减少。对地方来讲，原本营业税是其主体税种，而增值税是中央和地方分享税(分享比例75%：25%)，相对中央收入，地方收入会减少的更多。楼继伟称，总的考虑是维持目前中央和地方总的财力分配格局不变的情况之下，安排一个过渡性的中央地方收入划分办法，来解决地方收入减少的问题。

今年政府工作报告中表示，要合理的确定增值税的分享比例。四川省财政厅厅长王一宏对财新记者表示，地方期望是适当提高地方的分享比例。