在教育教学上，新医大长期坚持“严进严出、严格管理、从严治教”的教学理念，不断改善教学条件，强化教学管理，努力构建起了各民族医学人才教育教学质量共同提高、协调发展的培养模式。高度重视“以德育人”，遵循“以学生为主体，以素质教育为基础，以大学生思想政治教育为中心”的育人理念,向着全员育人、全过程育人、全方位育人的德育格局发展。

在科学研究上，多年来新疆医科大学始终围绕新疆重大疾病、特高发疾病防治及区域特殊药物资源开发展开科学研究工作。在新疆少数民族特高发疾病学、中维西医结合学、包虫病学等特色学科上，取得了可喜的成绩，在国内外产生了一定的影响。学校科研项目和科研经费不断增，2009-2013年期间分别获国家自然科学基金项目44项、65项、66项、77项、88项;省部级科研项目2009-2013年期间分别获省部项目64项、113项、147项、159项、189项。各类科研经费额由1998年的26.8万元增加到2013年的10300.6万元。

在医院建设和医疗服务上，学校临床教学及实习基地集中了全疆优质医疗资源，有6所直属附属医院，其中5所为三级甲等医院。在医院建设和医疗工作中，学校紧紧围绕新疆医疗卫生事业发展和各族人民健康需求，大力倡导以人为本、构建和谐医院的理念，推进医院的基础设施和内涵建设。经过多年的发展，6所附属医院的医疗条件和设施得到了较大改变，医疗技术水平和服务质量不断提高，基本实现了重大疾病不出疆即可得到满意治疗的目标，为各族群众提供了优质的医疗保健服务。一流的就医条件和先进的医疗技术吸引了大批周边国家的病人到附属医院求医就诊，附属医院的影响力不断提高。截止2013年12月底，各附属医院固定资产已达50.33亿元，总门诊人数545.57万人次，住院人数33.2万人次，手术例数13.73万例，实现业务收入61.25亿元。

在大学文化建设上，学校形成了“以现代文化为引领，以社会主义核心价值体系建设为核心，遵循大学文化建设发展的客观规律，紧紧围绕并服务于建设教学研究型大学的奋斗目标，坚持以人为本，以德为先，以创建高水平文明单位和构建学习型高校为载体，以努力形成新医大人的共同愿景与共同价值观、增强学校核心竞争力为目标，大力弘扬爱国精神、科学精神、人文精神、医学职业精神和新医大精神，全面推进精神文化、制度文化、学术文化、物质环境文化和行为文化建设，努力形成促进和谐、激励创新、催人奋进的浓厚文化氛围，建成体现时代特征、地域特点和新医大特色的大学文化，为实现学校发展目标提供强大动力和可靠保证”的大学文化建设总体要求。各族师生互相平等、互相理解、互相尊重、互相信任、互相学习、互相帮助，使校园里展现出团结和谐、奋发向上的精神风貌，为维护新疆的社会安全稳定与团结和谐做出了积极的贡献。我校先后荣获全国医学教育系统卫生文化建设先进单位、思想政治工作先进单位、全国“高校校园文化建设优秀成果”三等奖、自治区文明单位等荣誉称号和奖项。