口腔医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、管理学院、音乐学院、美术学院、舞蹈学院、预科教育学院、继续教育与职业教育学院。设有6个独立建制的科研机构：中国民族信息技术研究院、格萨尔研究院、海外民族文献研究所、伊斯兰文化研究所、甘肃省动物细胞工程技术研究中心、中国藏文典籍全文数字化研究所。

学校坚持“以人为本，助人成功”的办学理念，不断深化教育教学改革，大力加强学科专业建设。2000年以来，学校获国家级教学成果二等奖2项，甘肃省教学成果奖36项，国家民委教改项目23项。建有国家级精品视频公开课2门，省级精品资源共享课2门，省级精品课程35门。学校有1个国家级专业综合改革试点：社会学专业。有1个国家级卓越农林人才教育培养计划改革试点项目。有1个国家级教学团队：蒙古语言文学主干课程团队；7个省级教学团队：蒙古语言文学主干课程、藏语言文学主干课程、20世纪中国文学、精细化工、口腔内科学、西北少数民族历史与文化、口译课程。4个教育部特色专业建设点：中国少数民族语言文学、作曲与作曲技术理论、社会学、汉语言；9个省级特色专业建设点：数学与应用数学、化学工程与工艺、生物技术、会计学、历史学、阿拉伯语、口腔医学、食品科学与工程、金融学。有1个国家级实验教学示范中心：民族信息技术实验教学中心，1个国家级虚拟仿真实验教学中心：民族语言文化与教育虚拟仿真实验教学中心；6个甘肃省高校实验教学示范中心：公共基础实验教学中心、数字传媒实验教学中心、民族信息技术实验教学中心、电气电信实验教学中心、工程训练中心、动物细胞工程实验教学中心。

学校现有19个省部级重点学科。其中，7个国家民委重点学科：中国少数民族经济、马克思主义民族理论与政策、计算机应用技术、社会学、应用数学、法学、民族传统体育学；12个甘肃省重点建设学科：民族学、中国语言文学、中国史、计算机科学与技术、畜牧学、兽医学、宗教学、民俗学、格萨尔学、马克思主义理论、教育学、美术学。学校现有1个教育部创新团队：动物医学生物工程创新团队，建有10个校级创新团队。

学校建有3个甘肃省人文社会科学重点研究基地：西北少数民族文学研究中心、西北少数民族宗教研究中心、西北民族问题研究中心；1个省级哲学社会科学重大研究基地：民族地区经济社会发展研究中心；2个国家民委人文社科重点研究基地：西北民族文献研究基地、西北民族非物质文化遗产保护研究中心；1个教育部民族教育研究发展中心重点研究基地：西北民族教育重点研究基地；中国统一战线理论研究会民族宗教理论甘肃研究基地。学校成为“民族信息科学与技术协同创新中心”牵头单位，成为“一带一路安全问题协同创新中心”、“中国多民族文化凝聚与国家认同协同创新中心”、“丝绸之路与华夏文明传承发展协同创新中心”核心协同单位。建有国家民委——教育部共建重点实验室：中国民族语言文字信息技术实验室；4个国家民委重点实验室：藏文信息技术实验室、生物工程与技术实验室、口腔医学实验室、电子材料实验室。同时，建有1个省级工程中心：甘肃省动物细胞工程技术研究中心；3个甘肃省重点实验室：甘肃省新型建材与建筑节能重点实验室、甘肃省民族语言智能处理重点实验室（培育基地）、甘肃省口腔疾病研究重点实验室（培育基地）；甘肃省高校环境友好复合材料及生物质利用重点实验室。