经过50多年的发展，学校现已成为集哲学、经济学、法学、文学、历史学、理学、工学、农学、管理学、艺术学10大学科门类在内的综合大学。蒙古学、生命科学、资源与环境学科群具有鲜明的民族特色和地区特色，一批骨干学科也正在快速发展。学校现由校本部、艺术学院、交通学院、鄂尔多斯学院、满洲里学院构成，共设有23个学院和1个公共教学部，另设有1个独立二级学院——创业学院;有内蒙古草地生态学重点实验室省部共建国家重点实验室培育基地、哺乳动物生殖生物学及生物技术实验室省部共建国家重点实验室培育基地、哺乳动物生殖生物学及生物技术教育部重点实验室、牧草与特色作物生物技术省部共建教育部重点实验室、优良家畜规模化繁育技术教育部工程研究中心、乳制品质量安全控制技术教育部工程研究中心、农业部草食家畜繁殖生物技术与育种重点实验室、教育部人文社会科学重点研究基地蒙古学研究中心，以及27个自治区级重点(工程)实验室、工程技术研究中心、人文社会科学重点研究基地。现有中国少数民族语言文学、动物学2个国家重点学科，生态学国家重点培育学科;有18个自治区重点学科，8个自治区重点培育学科。学校现有7个博士学位授权一级学科、26个硕士学位授权一级学科，此外还有3个二级学科博士学位授权点、6个二级学科硕士学位授权点，8个硕士专业学位授权点，6个博士后科研流动站;有78个本科专业，蒙古语言文学、生物学、生命科学与技术、数理学4个国家人才培养基地，国家大学生文化素质教育基地，文史哲、化学2个自治区人才培养基地。