此外学校公开出版《中国医学科学杂志（英文版）》、《中国医学科学院学报》等97种期刊，设有北京协和医学院出版社。

4 教学基地

学校拥有六所附属医院：北京协和医院、阜外心血管病医院、肿瘤医院、整形外科医院、血液病医院（天津）、皮肤病医院（南京）。所属医院技术力量雄厚，学术水平领先，是闻名国内外的集医疗、教学和科研为一体的综合性医疗服务体系。其中北京协和医院以其专家优势、技术优势、资源优势被国家卫生部指定为“全国疑难病症技术指导中心”之一，它所拥有的病案室与名教授和图书馆一起被誉为“协和三宝”；阜外心血管病医院是国内最大的三级甲等心血管病专科医院；肿瘤医院是亚洲地区最大的肿瘤专科医院，是世界卫生组织癌症研究合作中心之一；整形外科医院是世界上规模最大、技术力量最强的整形外科三级甲等专科医院；位于天津的血液病医院是我国唯一的临床与基础研究相结合的国家级血液学专业临床与科研机构，医院对常见血液病，特别是恶性血液病的诊断治疗处于国内领先水平；位于南京的皮肤病医院是目前全国最大、技术最先进的从事皮肤病研究的专科医院，是全国性病麻风病控制中心，在各种疑难皮肤病、性传播疾病和麻风病的诊治上为全国的医疗机构提供技术指导。北京协和医院的综合实力和各个专科医院的技术力量奠定了协和医大的临床医疗水平在中国现代医疗技术领域中的代表地位，为学生在临床实践中提高基本技能、基本操作创造了良好的条件。

国际化办学

为了使办学实现“三个面向”，协和医大十分重视国际学术交流和科技合作，与近20个国家（地区）的医学院校和科研机构建立起学术交流和科技、教育、医疗合作关系，成立了９个世界卫生组织合作中心，并已成为国际生物医学研究高层组织（HIROS）成员单位，合作项目正在逐步洽谈和展开。通过与世界卫生组织研究合作中心的合作和交流，引进智力，争取资金，促进了科研、医疗和教育的发展。目前协和已授予200余名国外专家、学者为协和医大名誉教授或客座教授，其中就有美国NIH院长Elias A.Zerhouni,美国科学院、工程院、医科院，中国科学院外籍院士冯元桢，诺贝尔奖获得者LeeH Hartwell、Tim Hunt、John Walker、丁肇中等。

目前学校与美国哈佛大学医学院、美国加州大学旧金山分校医学院、香港中文大学医学院签订了校际交流的协议，互相交换高年级学生到对方学校进行短期临床学习。