文山学院前身是1947年2月由云南昭通南迁至文山的国立西南师范学校，1955年10月，经云南省人民政府批准，在国立西南师范学校基础上成立云南文山师范学校。1958年秋，在文山师范学校内开办文山人民大学，招收师专和医专各一个班，后因故停办。1977年，经云南省教育厅批准，在文山师范学校附设师专班，1984年经云南省人民政府批准成立文山师范专科学校，全国人大原副委员长楚图南先生为学校题写校名，1992年更名为文山师范高等专科学校，2009年4月，教育部批准升格为全日制普通本科院校。

学校自创办以来，始终坚持在“老、少、边、山、穷、战”地区办学，走出了一条艰苦创业的发展之路。目前，学校占地面积923亩，校舍面积27万平方米，图书馆纸质藏书95万册，固定资产总值2.89亿元，设备总值4747万元；有在职教职工568人，其中专任教师457人，副高以上职称教师158人（教授、研究员30人，其中二级教授1人；副教授、副研究员128人），拥有硕士以上学位教师280人，10余位教师先后被云南师范大学、昆明理工大学、云南农业大学聘为硕士生导师。学校下设文山三七研究院、文山州生物资源开发研究中心、文山民族文化传承与创新研究中心3个学术科研机构，建有“云南省三七工程技术研究中心”、“云南省三七农业工程实验室”、“云南省高校三七应用技术重点实验室”、“云南省高校特色植物资源开发利用工程中心”、“赵大庆专家工作站”等省级研究中心、实验室和专家工作站。综合性学术期刊《文山学院学报》面向国内外公开发行。学校下设人文学院、政法经济学院、数学学院、外国语学院、化学与工程学院、环境与资源学院、信息科学学院、教育科学学院、体育学院和艺术学院10个二级学院和思想政治理论课教学研究部，有49个本、专科专业(本科33个)，涵盖文学、理学、工学、教育学、艺术学、历史学、法学、管理学、农学9个学科门类。现有省级教学团队2个，省级创新团队1个，省级优势特色重点学科1个，省级特色专业（群）5个，省级精品课程2门，省“十二五”规划教材2部，云南省教学名师3人，入选云南省技术创新人才培养计划5人，入选“云岭产业技术领军人才”培养计划1人；获云南省高等教育教学成果二等奖1项。“升本”以来，教师获各级各类课题立项283项，出版学术专著35部，参编著作、教材30部；获国家专利授权10项，实现科技成果转化8项，13项科技成果获云南省科学技术进步二等奖，30余项获州科学技术进步一、二、三等奖，1项获州科学技术进步贡献奖；发表学术论文2243篇，其中核心期刊199篇，SCI、EI收录31篇。