学院占地1028亩，建筑面积19.75万平方米，分为两个校区。老校区位于济南市历城区遥墙镇，占地420亩，建筑面积5.05万平方米，建有教学楼2栋，办公楼1栋，学生公寓楼3栋，大小学生职工餐山东杏林科技职业学院厅3个，风雨运动场面积10000平方米，图书馆、阅览室各1个，设有超市、储蓄所、邮局、卫生室、洗衣房、理发室、开水房、锅炉房（冬季供暖）等，生活设施一应俱全。

新校区位于济南市东部大学城，依山傍泉，占地608亩，总建筑面积14.7万平方米，包括能容纳万名学生同时上课的教学楼1栋（30000平方米），多功能综合实验楼1栋，图书馆1座，高档学生公寓5栋，学生餐厅1栋，风雨运动场60000平方米。另有二期工程6栋学生公寓、一栋现代化综合图书楼约50000平方米，正在建设中，2006年9月正式投入使用。

为满足各专业实验实训教学的需要，学院加大基础教学设施投入，现有各类教学仪器设备总价值为3000万元，其中适用于医学类专业教学仪器设备总值1600万元，同时还建有多功能的现代化实验中心，拥有各类专业实验室56个，品牌计算机1000台，数字语音设备598座，解剖标本室、解剖模型室、解剖多媒体主控室、显微镜实验室、化学实验室、生物化学实验室、机能实验室、病理室、临床诊断实验室、手术室、妇产科实验室、口腔实验室、口腔技工实验室、护理实验室、护理示教室、针灸推拿按摩实验室、中药实验室等30个医学实验室，能充分满足各学科各专业的实验实训教学需要。各专业实验课开出率均达到90％以上，医学类实验课开出率达98％。学院目前藏书41万册，学生运动场地6万平方米。

学院现有章丘市中医院、淄博市第八人民医院两所附属医院，另有济南市、章丘市等3所非直属附属医院，另与全省20多所二级甲等以上综合医院签订教学与实习协议，并与50多家大中型企业签订实训、实习就业基地协议，为学生技能培训和实践操作能力的提高提供了有力的保障。