南京医科大学创建于1934年，时名江苏省立医政学院。1957年，由镇江迁至南京，更名为南京医学院。1962年，被列为全国首批六年制医药院校。1981年，被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，更名为南京医科大学。学校是江苏省属重点建设高校。2015年9月，获准成为首批教育部、国家卫生计生委与省政府共建医学院校。

　　学校设有22个学院（部）和1个独立学院——康达学院。在江苏、上海、浙江、山东等地拥有24所附属医院和50多所教学医院。学校现有在职教职工1600多人，其中学校编制专任教师825人。有教授188人、副教授252人，有博士生导师422人、硕士生导师1746人（含附属医院）。学校现有中国工程院院士1名，美国国家医学院外籍院士1名，“长江学者”特聘教授3名，“长江学者奖励计划”青年学者1位，国家“千人计划”7人，国家杰出青年科学基金获得者7人，优秀青年基金获得者8人，国家级教学名师1人，入选“教育部新世纪优秀人才支持计划”7人，“江苏特聘教授”20人，“国家级教学团队”3个，教育部“创新团队”1个。学校是江苏省高层次人才培养计划——“333工程”培训基地。教育人才工作多次获得江苏省教育厅表彰。

　　学校现有一级学科博士学位授权点8个（基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、药学、特种医学、护理学、人文医学）、二级学科博士学位授权点50个；一级学科硕士学位授权点11个、二级学科硕士学位授权点73个；博士后科研流动站7个，学位授权点已覆盖医学、理学、工学、管理学、法学、教育学和文学等7个学科门类；拥有3个国家重点学科、1个国家重点培育学科、28个国家临床重点专科、2个江苏省一级学科国家重点学科培育建设点、3个江苏省一级学科重点学科。临床医学、分子生物学与遗传学、生物学与生物化学、神经科学与行为学、药理学和毒理学5个学科进入ESI全球排名前1%。基础医学、公共卫生与预防医学、临床医学、口腔医学是江苏省高校优势学科。