吉林医药学院始建于1952年，前身为中国人民解放军第四军医大学吉林军医学院，共为军队和地方培养了3万余名医务人才，被誉为“白衣战士的摇篮”。2004年8月，学校由军队整体移交吉林省，成为省属公办高等学校，是吉林省惟一独立设置的西医本科院校。2013年通过教育部本科教学工作合格评估。

学校是国家绿化模范单位、吉林省园林式单位。校区位于吉林市吉林大街5号，校本部占地面积52.73万平方米，建筑面积27.42万平方米，固定资产11.41亿元，教学、科研仪器设备总值1.66亿元。馆藏纸质图书85.91万册，中外文数据库23个；文体活动中心建筑面积0.50万平方米；室内外体育运动场所占地面积5.52万平方米；校园主干网为千兆带宽。

学校现有16个党政机关、3个群团组织、13个教学单位、5个教辅单位；2所附属医院（第一临床医学院附属四六五医院、第二临床医学院附属梅河口市中心医院）和2所非直属附属医院（附属吉林省吉林中西医结合医院、附属吉林油田总医院），均为三级甲等医院；各类实践教学基地134家。

校本部现有专任教师492人，其中硕士及以上学位教师342人，高级职称216人。新世纪百千万人才工程国家级人选1人，全国优秀科技工作者1人，享受国务院政府特殊津贴专家1人，教育部新世纪优秀人才支持计划人选1人，省拔尖创新人才5人（第一层次人选1人），长白山学者特聘教授１人，省突出贡献中青年专业技术人才3人，省青年科技奖1人，省高校首批学科领军型教授1人，省教学名师4人，省优秀教师2人。

学校现开设18个本科专业，6个专科专业，以医学专业为主，涵盖医、理、工、管4个学科门类。现有国家级特色专业1个，省级特色专业4个，省级品牌专业建设点2个，省级人才培养模式创新实验区3个，省级优秀教学团队7个，省级实验教学示范中心4个（建设单位2个），国家精品资源共享课1门，国家级精品课程１门，省级精品课程16门。省高校“十二五”优势特色重点立项建设二级学科2个，重点立项培育一级学科1个。现有科研实验平台18个，“院士工作站”1个，省教育厅重点实验室3个、省教育人文社科重点研究基地1个，省卫生厅重点实验室2个，省工信厅实验中心1个，省中医药管理局实验平台10个。