第十二条为贯彻“以人为本”的教育理念，学校给予部分优秀本科学生转专业机会，新生入学后可依照当年执行的《长春中医药大学本科优秀学生转专业管理办法》进行申请。

学校现有国家级特色专业建设点4个，国家级专业综合改革试点专业1个，省级品牌专业建设点6个，省级特色专业8个。有国家级精品资源共享课2门，国家级精品课程3门，国家级人才培养模式创新实验区1个，主编国家级“十二五”规划教材4部，主编国家级“十二五”行业规划教材45部。入选国家级大学生文化素质教育基地，国家级中医药文化宣传教育基地。
学校有较强的科研实力，建立了较完备的中医药科学研究体系，现有52个国家级和省部级科研平台，“十二五”期间，承担了国家973项目、国家重大药物创制、国家自然科学基金项目等重大重点科技项目84项，取得了163项高水平的科研成果，有47项科技成果实现了转化，走出了学研产相结合，服务地方经济社会发展的特色办学之路。
学校不断拓展国际化办学视野，是教育部首批批准接收和培养外国留学生及台港澳地区学生和中国政府奖学金来华留学生接收院校，与21个国家和地区的高校、研究单位保持着长期的友好往来，开展广泛的学术交流与合作。
多年来，学校建设发展得到社会各界的广泛赞誉和各级政府的充分肯定，荣获“全国文明单位”称号，被教育部授予“全国毕业生就业典型经验高校”。基础医学院荣获“全国教育系统先进集体”称号；附属医院荣获“全国五一劳动奖状”、“全国卫生系统先进集体”、“全国援外医疗工作先进集体”等称号。