ISIS形成于2004年前后，是美国入侵伊拉克后，由伊境内多个圣战组织联合组成的。2004年10月，组织领导人、约旦籍人穆萨卜·扎卡维向当时尚在世的本·拉丹宣誓效忠，因此ISIS成立之初是基地组织伊拉克分支。其时，组织成员主要是外国赴伊拉克的反美武装人员。

2006年1月，基地组织伊拉克分支和伊拉克当地一些逊尼派反美武装组织合并后，更名为圣战者协商会议。同年10月，圣战者协商会议与其他四个伊拉克反美武装组织以及一些逊尼派部族代表举行会议，宣誓要把伊拉克从什叶派统治下解放出来。随后，伊拉克伊斯兰国（ISI）宣告成立，也被视为是今天的ISIS首次亮明建国诉求。但遭遇伊拉克境内和多个国际圣战组织的反对。反对者认为，在伊拉克成立另一个伊斯兰国家，与国际圣战运动建立泛阿拉伯联盟的目标不一致。
2008年，ISI以伊拉克平民为袭击目标的错误战略，导致它的本土同盟者离心离德。在时任驻伊美军最高指挥官彼得雷乌斯团结伊本土势力的成功政策下，觉醒委员会等伊拉克逊尼派武装组织开始放弃反美立场，转而与基地组织和ISI等外国势力作战。ISI陷入深重危机中。

但几年后，叙利亚危机的爆发使ISI重获生机。该组织以加入叙利亚圣战为口号，重新赢得了伊拉克逊尼派武装人员的支持。沙特阿拉伯和卡塔尔等逊尼派海湾国家加大了对ISI的经济和武器援助，更多外国人加入其中。

去年4月9日，ISI正式更名为伊拉克和黎凡特伊斯兰国，由于黎凡特是古代地域概念，广义黎凡特地区包括东地中海塞浦路斯、叙利亚、伊拉克、黎巴嫩、约旦、巴勒斯坦和土耳其等现存主权国家和地区下辖领土。借此，ISIS清楚表明了其最终诉求是建立地跨多国多地的宗教大国。
伊拉克isis有多少人：

这是一个由基地组织延伸而来最后却与其分道扬镳的恐怖组织，这是一个以800人打残伊拉克政府军3万人并在几个月内攻下伊拉克数座城池的武装组织，这还是一个屡屡被曝虐杀俘虏、热衷斩首的极端组织。从今年1月份起，这个组织越来越让全世界震惊，这个组织的名字叫ISIS(伊拉克和黎凡特伊斯兰国)。如今该组织更名为IS（伊斯兰国）。

　　6月29日，ISIS宣布正式建立宗教国家，头目阿布·贝克尔·巴格达迪为国家的领导人，即哈里发。目前，这个国家控制的地区跨越伊拉克和叙利亚，在伊叙边境两侧占据近20万平方公里土地。