牡丹江医学院创建于1958年，著名史学家郭沫若先生题写了校名。是黑龙江省东南部地区唯一一所省属全日制普通本科医药院校。1997年一次性通过原国家教委合格评估。2005年经黑龙江省学位委员会批准为新增硕士学位立项建设单位。2006年在国家本科教学水平评估中专家组给予了优秀的评价。

学院现有教职工2300人，具有副高级以上职称550人。专任教师496人，博士62人，其中留学归国博士6人，硕士288人，硕士以上学历人员占专任教师的62%。有兼职博士研究生导师3人、硕士研究生导师30人。有11人担任国家级学会理事，13人担任省级学会副理事长，77人担任省级学会理事等学术职务。

学院占地面积72.5万平方米，建筑面积30.9万平方米，图书馆藏书100多万册，中外文期刊2257种，校园网络系统先进，拥有各类网上教学资源3126部。教学科研仪器设备总值1.7亿元，固定资产总值近6亿元。《牡丹江医学院学报》在全国公开发行。

学院有8所附属医院，总床位数6080张。其中直属附属医院2所，床位2000张。附属红旗医院是具有1200张床位的“全国百姓放心医院”、“全国示范医院”，是黑龙江省东南部地区具有明显优势的三级甲等医院。

学院面向全国25个省（市）、自治区招收本科生，现有全日制在校本、专科学生9490人。开设临床医学、医学影像学、麻醉学、医学检验学、护理学、康复治疗学、口腔医学、药学、制药工程、药物制剂、预防医学、信息管理与信息系统、公共事业管理、应用心理学、市场营销15个本科专业。其中医学影像学、麻醉学、医学检验专业是省级重点专业，医学影像学专业是省级一类特色专业和国家级一类特色建设专业。人体解剖学、组织胚胎学、生物遗传学、病原生物学、影像设备学、诊断学是省级精品课程，内科学、机能学实验是省高校教学团队。