福建医科大学创建于1937年，前身是福建省立医学专科学校，首任校长侯宗濂（1900年-1992年），系中国近现代著名生理学家和医学教育家。经过78年的建设发展，学校已形成学士、硕士、博士人才培养体系和“勤奋、严谨、求实、创新”优良校风，成为一所集教学、科研、医疗、预防和社会服务为一体的省属医科大学。2003年，福建省人民政府确定我校为省属重点建设高校。近年来，学校先后被评为“全国教育系统抗震救灾先进集体”、福建省党建和思想政治工作先进高校、省文明学校、省“依法治校”示范校、省“校务公开”示范校、省计划生育先进单位、省卫生先进单位、省绿化模范单位和省级花园式单位等。

学校现有上街、台江2个校区，占地约1500亩，校舍建筑面积40多万平方米。

学校现有在校生21900多人，其中全日制的本科生13000多人、博士研究生250多人、硕士研究生2400多人。设有研究生院、基础医学院、公共卫生学院、医学技术与工程学院、药学院、护理学院、口腔医学院、外国语学院、人文学院、协和临床医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、省立临床医学院、福总临床医学院、临床教学部、思想政治理论课教学研究部、体育教学研究部、海外教育学院、成人教育学院、继续教育学院等20个学院（部）。

学校形成了较为合理的学科专业结构，现有基础医学和临床医学2个博士一级学科授权点，14个硕士一级学科授权点，27个博士二级学科授权点，52个硕士二级学科授权点。根据国际权威机构ESI最新统计，我校临床医学学科从2009年起已经进入全球同类机构前1%，2016年全国排名第34位。学校拥有福建省国家重点学科培育建设学科1个，国家临床重点专科9个，省级临床重点专科13个，省“211工程”重点学科2个，省特色重点学科4个，省级重点学科9个。设有普通本科专业26个，覆盖了文、理、医、管、法等5个学科门类。其中国家级特色专业4个，省级特色专业8个，国家级人才培养模式创新实验区1个，省级人才培养模式创新实验区7个，国家级精品课程1门，省级精品课程36门。“十二五”期间获批1个国家级专业综合改革试点和6个省级专业综合改革试点项目。