蚌埠医学院是安徽建校最早、国家首批具有学士和硕士学位授予权的高等学府之一。学校坐落在“禹风厚德、孕沙成珠”的国家重要交通枢纽城市——蚌埠，濒临千里淮河，傍依灵秀曹山，承山水涵养之灵气，传杏坛济世之流芳，是安徽省属普通高等医学本科院校、第三军医大学博士研究生联合培养单位、安徽省院士工作站和博士后岗位设置单位，是国家第一批卓越医生教育培养计划试点高校、安徽省高校综合改革首批试点单位。

1958年7月，为加快安徽建设，国家将原上海第二医学院（现上海交通大学医学院）分迁一半至蚌埠，并抽调原安徽医学院部分优秀师资创建了蚌埠医学院。1968年8月，学校经安徽省革委会批准改称蚌埠反修医学院，干部、医护人员组成医疗队，下放到皖北农村从事医疗工作。1970年9月，安徽省革委会决定将本省四所医学院校合并为安徽医学院。合并后，蚌埠反修医学院改称安徽医学院蚌埠分院。1974年6月，国务院科教组发文通知恢复蚌埠医学院。在近60年办学历程中，谢炘、洪抡元、朱仁宝、赵德焜、沈乃葵、李同度、黄恭康、黄谷良、林特夫、杨永康、李涤生、黄泳齐、朱继业、秦学祥、葛成荫、沈础仁、蒋维良、王佩瑶、沈履贤、唐清里、赵家桂、盛承安等一大批知名专家学者先后汇聚在禹王故里、龙子湖畔，著书立说，悬壶济世。

经过一代代蚌医人薪火相继、潜心耕耘，励精图治、德业日新，孕育铸就了“艰苦创业、严谨治学、精诚为医、团结奉献”的蚌医精神，砥砺凝练出“笃学、精业、修德、厚生”的校训传统。建校以来，学校已经培养出各类医学人才六万余名，其中有以中国工程院院士刘德培、中国科学院院士段树民、陈孝平、王福生等为代表的医学领军人物；有以“白求恩奖章”获得者，阜阳人民医院儿科刘晓林医生为代表、技术精湛的专业人才；更有一大批扎根基层、救死扶伤、深受群众信赖的临床业务骨干和医药卫生管理干部，为国家医药卫生事业和经济社会发展做出了重要贡献。

学校现已形成医学、理学、工学、管理学4个学科门类协调发展的教育格局。有临床医学、麻醉学、口腔医学、护理学、医学检验技术、医学影像学、医学影像技术、精神医学、预防医学、食品卫生与营养学、药学、药物分析、生物科学、生物技术、信息管理与信息系统、医学信息工程、制药工程、食品质量与安全、物联网工程、康复治疗学、应用统计学、应用心理学、卫生检验与检疫等23个本科专业，有基础医学、临床医学和护理学3个一级学科硕士学位授权点和临床医学、口腔医学和公共卫生3个硕士专业学位授权点，29个二级学科授权点。其中临床医学学科进入ESI全球排名前1%。学校拥有1个国家级特色专业，1个国家新药Ⅰ期临床研究基地，7个省级特色专业，5个省级综合改革试点专业，9个省级重点学科、特色专科，3个省级重点实验室，1个省级工程技术中心，1个省人文社科重点研究基地，1个安徽省生化药物产业技术创新战略联盟，2个省级实验教学示范中心，2个省级人才培养模式创新实验区。学校是国家级大学生创新创业实践基地和校外实践基地，教育部临床医学“5+3”改革试点高校、医学检验技术专业综合改革试点高校和临床技能综合培训中心。